rbenvを使うには~/.bash_profileなりなんなりで環境変数を適切に設定してやる必要がある。というわけで、systemdのように通常のシェルと環境変数を共有していない(~/.bash_profileを経由しない)環境でrbenvなRubyを使おうとするとうまくいかないケースがある。

rbenv: version `XXX' is not installed編

前提：
- 環境変数RBENV_ROOTが設定されていない。
- rbenvをシステムワイドインストールなどのために~/.rbenv以外のところに置いている(以下では/opt/rbenvにあるとして説明する)。
問題：/opt/rbenv/shims/bundle exec ...では動くのに、/opt/rbenv/bin/rbenv exec bundle exec ...ではrbenv: version `XXX' is not installedとなって動かない。
理由：rbenvはインストールされたバージョンを探すのに${RBENV_ROOT}/versions/XXXを見る。/opt/rbenv/shims/bundleは途中でRBENV_ROOT環境変数を正しくセットするけれど、/opt/rbenv/bin/rbenv execはそうしないので、あるべき場所を探せず、見つからない。
解決策：/opt/rbenv/shims/bundle exec ...でかまわない。

`-bash: ruby: command not found`編

引き続きrbenvは/opt/rbenvにあるとして説明する(が、こちらは~/.rbenvにあっても起きそう)。

前提：
- $PATHに/opt/rbenv/shimsが入っていない。
- rbenv-binstubsを使っている。
- BUNDLE_BIN: ".bundle/bin"である(すなわちbundle install --binstubs=.bundle/binとした)として説明する。ちなみにパスを指定していなければbinになる(これはRails4以降と衝突することで有名)。
問題：/opt/rbenv/shims/bundle exec ...すると-bash: ruby: command not foundとなって動かない。
原因：
- どこかで#!/usr/bin/env rubyしていて動いていない。本来はrbenvが$PATHに/opt/rbenv/versions/XXX/binを加えていて、ここにruby実行ファイル(正確にはそのラッパー)があるので動く。
- $PATHに加えられるべき/opt/rbenv/versions/XXX/binは、rbenv whichを内部的に呼んでその結果を使っている。
- rbenv-binstubsは、rbenv whichに割り込んで、/opt/rbenv/versions/XXX/binより先にカレントディレクトリの下.bundle/binを探す。ここにbundleが入っているとこちらがrbenv whichの結果として返されて$PATHに追加されるが、ここにはrubyは(当然)いない。$PATHに/opt/rbenv/shimsが入っていなければrubyが見つからないことになる。
- ($PATHに/opt/rbenv/shimsが入っていればこっちのrubyがあるのでちゃんと動く。)
解決策：
- とりあえず.bundle/bin/bundleを消せば動くようになる。
- 抜本的には、bundle install --binstubs=.bundle/binとせず、必要なgemに限ってbundle binstubs <gemname> --path=.bundle/binとするのがよい。