VSCodeで実行するPython起動ファイルの変更方法について

Pathを設定する必要があると思います。
おそらく、今はPathにC:\Python39が入っているので、python3.9.4が実行されていると思われます。
なので、Pathからpython3.9.4へのパス（C:\Python39）を取り除いて、新たにpython3.8.9へのパスをPathに追加する必要があると思います。

全く同じではありませんが、下記のページが参考になると思います。

つまりpowershellでpythonと打ち込んだ場合、VSCodeの左下とは関係なく、システム環境変数の上の方のPathにあるpython.exeが優先されるということですね。

はい、そう思います。

では、VSCodeの左下は何のためにあるのでしょうか。

VSCodeの左下（おそらく、VSCodeのPythonの拡張機能のことだと思いますが）は、VSCodeからPythonスクリプトを実行する時に使用するPythonを指定するものだと思います。

VSCodeのPythonの拡張機能を使うと、メニュー→実行→デバッグなしで実行で、VSCodeからPythonスクリプトを実行することができます。

例えば、私の場合、左下でPython 2.7.16 64-bitを選んでから、下記の、実行時に使用するPythonのバージョンを確認するスクリプトを実行すると

import sys

print(sys.version)

下記のように表示されます。

2.7.16 (default, Jun  5 2020, 22:59:21)

また、左下でPython 3.7.3 64-bitを選んでから、上記の確認スクリプトを実行すると、下記のように表示されます。

3.7.3 (default, Aug  4 2020, 19:30:55)