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alpineLinuxを用いたk8s構築(web/ap/dbサーバ)~ディスク拡張編~

Last updated at Posted at 2023-04-29

ディスク拡張をする目的

KubernetesやDockerを構築時、Dockerの実態ファイルは /var/lib/docker/overlay2/配下に作成されます。
Dockerコンテナが増えるにつれて、/varは肥大化するため、/varのパーティションを設けている場合、ディスク拡張が必要になります。

元々、/varを3GB以内で構築する予定でしたが、minukubeを入れたりほかのDockerコンテナを入れるなどし枯渇したため、3GBから13GBまでディスク拡張をします。
今回はVMWarePlayerWorkstationを利用し、ディスク拡張を行います。

VMWareにおけるディスク拡張方法

以下の通りです。(図や細かい手順については後ほど記載いたします。)

仮想ディスク増設

ディスク展開を選択し、増量したい文だけ増量します。
image.png

事前作業(念のために実施すること)

ディスク使用率を調査します。

[root@homeserver ~]# df -h
ファイルシス            サイズ  使用  残り 使用% マウント位置
/dev/mapper/centos-root   7.0G  2.5G  4.6G   36% /
devtmpfs                  475M     0  475M    0% /dev
tmpfs                     487M     0  487M    0% /dev/shm
tmpfs                     487M  7.8M  479M    2% /run
tmpfs                     487M     0  487M    0% /sys/fs/cgroup
/dev/sda1                1014M  133M  882M   14% /boot
/dev/mapper/centos-opt    3.0G   33M  3.0G    2% /opt
/dev/mapper/centos-home   2.0G   33M  2.0G    2% /home
/dev/mapper/centos-var    3.0G  1.6G  1.5G   51% /var
overlay                   3.0G  1.6G  1.5G   51% /var/lib/docker/overlay2/127f56b89fdbb3eff6603ca6c1cba3fc918511b33f2a60d555fd1e37c77dd31d/merged
overlay                   3.0G  1.6G  1.5G   51% /var/lib/docker/overlay2/3299384c258001fe7268c873b42272f979d6b3a523811d482a8512b975397953/merged
shm                        64M     0   64M    0% /var/lib/docker/containers/e8ea26267f9d406c2b7f5ac2f8f43887013bdb1b73d520936bd2fda5e01817b7/mounts/shm
shm                        64M     0   64M    0% /var/lib/docker/containers/cb17ae5ed63e305df49626bd036f39e772783c097e20b94a030b303327d35cd2/mounts/shm
tmpfs                      98M     0   98M    0% /run/user/0

dockerが起動していれば停止します。

[root@homeserver ~]# docker ps -a
CONTAINER ID   IMAGE     COMMAND                  CREATED      STATUS              PORTS                    NAMES
cb17ae5ed63e   redmine   "/docker-entrypoint.…"   9 days ago   Up About a minute   0.0.0.0:3000->3000/tcp   redmine
e8ea26267f9d   mariadb   "docker-entrypoint.s…"   9 days ago   Up About a minute   0.0.0.0:3306->3306/tcp   redmine-db
[root@homeserver ~]# ls -ltr
合計 2776
-rw-------. 1 root    root    1254 10月 26  2019 anaconda-ks.cfg
drwxr-xr-x. 2 polkitd root       6  3月  3 16:36 mySql
-rw-r--r--. 1 root    root    4057  3月  3 17:11 testhoge.txt
drwxr-xr-x. 2 root    root     108  3月  3 19:10 dockerfiles_template
drwxr-xr-x. 3 root    root      44  3月  3 23:23 docker-redmine
-rw-r--r--. 1 root    root 2824458  3月  3 23:56 docker-redmine_1.0.0.tar.gz
-rwxr-xr-x. 1 root    root      51  3月  4 00:03 start_redmine.sh
-rwxr-xr-x. 1 root    root      50  3月  4 00:04 stop_redmine.sh
[root@homeserver ~]# ./stop_redmine.sh
e8ea26267f9d
cb17ae5ed63e
[root@homeserver ~]# docker ps -a
CONTAINER ID   IMAGE     COMMAND                  CREATED      STATUS                     PORTS     NAMES
cb17ae5ed63e   redmine   "/docker-entrypoint.…"   9 days ago   Exited (1) 3 seconds ago             redmine
e8ea26267f9d   mariadb   "docker-entrypoint.s…"   9 days ago   Exited (0) 3 seconds ago             redmine-db
[root@homeserver ~]#

fdiskの確認

[root@homeserver ~]# fdisk -l

Disk /dev/sda: 32.2 GB, 32212254720 bytes, 62914560 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト
Disk label type: dos
ディスク識別子: 0x000edcb8

デバイス ブート      始点        終点     ブロック   Id  システム
/dev/sda1   *        2048     2099199     1048576   83  Linux
/dev/sda2         2099200    41943039    19921920   8e  Linux LVM

Disk /dev/mapper/centos-root: 7511 MB, 7511998464 bytes, 14671872 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト


Disk /dev/mapper/centos-swap: 4294 MB, 4294967296 bytes, 8388608 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト


Disk /dev/mapper/centos-opt: 3221 MB, 3221225472 bytes, 6291456 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト


Disk /dev/mapper/centos-var: 3221 MB, 3221225472 bytes, 6291456 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト


Disk /dev/mapper/centos-home: 2147 MB, 2147483648 bytes, 4194304 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト

[root@homeserver ~]# 

fdisk再設定・パーティション設定変更

設定変更をします。ただし、ボリューム拡張はOS再起動をする必要がありますので、
/dev/sda2のブロックサイズが反映されているかまでを確認します。

[root@homeserver ~]# fdisk /dev/sda
Welcome to fdisk (util-linux 2.23.2).

Changes will remain in memory only, until you decide to write them.
Be careful before using the write command.


コマンド (m でヘルプ): m
コマンドの動作
   a   toggle a bootable flag
   b   edit bsd disklabel
   c   toggle the dos compatibility flag
   d   delete a partition
   g   create a new empty GPT partition table
   G   create an IRIX (SGI) partition table
   l   list known partition types
   m   print this menu
   n   add a new partition
   o   create a new empty DOS partition table
   p   print the partition table
   q   quit without saving changes
   s   create a new empty Sun disklabel
   t   change a partition's system id
   u   change display/entry units
   v   verify the partition table
   w   write table to disk and exit
   x   extra functionality (experts only)

コマンド (m でヘルプ): p

Disk /dev/sda: 32.2 GB, 32212254720 bytes, 62914560 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト
Disk label type: dos
ディスク識別子: 0x000edcb8

デバイス ブート      始点        終点     ブロック   Id  システム
/dev/sda1   *        2048     2099199     1048576   83  Linux
/dev/sda2         2099200    41943039    19921920   8e  Linux LVM

コマンド (m でヘルプ): d
パーティション番号 (1,2, default 2): 2
Partition 2 is deleted

コマンド (m でヘルプ): p

Disk /dev/sda: 32.2 GB, 32212254720 bytes, 62914560 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト
Disk label type: dos
ディスク識別子: 0x000edcb8

デバイス ブート      始点        終点     ブロック   Id  システム
/dev/sda1   *        2048     2099199     1048576   83  Linux

コマンド (m でヘルプ): n
Partition type:
   p   primary (1 primary, 0 extended, 3 free)
   e   extended
Select (default p): p
パーティション番号 (2-4, default 2):
最初 sector (2099200-62914559, 初期値 2099200):
初期値 2099200 を使います
Last sector, +sectors or +size{K,M,G} (2099200-62914559, 初期値 62914559):
初期値 62914559 を使います
Partition 2 of type Linux and of size 29 GiB is set

コマンド (m でヘルプ): p

Disk /dev/sda: 32.2 GB, 32212254720 bytes, 62914560 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト
Disk label type: dos
ディスク識別子: 0x000edcb8

デバイス ブート      始点        終点     ブロック   Id  システム
/dev/sda1   *        2048     2099199     1048576   83  Linux
/dev/sda2         2099200    62914559    30407680   83  Linux

コマンド (m でヘルプ): w
パーティションテーブルは変更されました!

ioctl() を呼び出してパーティションテーブルを再読込みします。

WARNING: Re-reading the partition table failed with error 16: デバイスもしくはリソースがビジー状態です.
The kernel still uses the old table. The new table will be used at
the next reboot or after you run partprobe(8) or kpartx(8)
ディスクを同期しています。
[root@homeserver ~]# fdisk -l

Disk /dev/sda: 32.2 GB, 32212254720 bytes, 62914560 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト
Disk label type: dos
ディスク識別子: 0x000edcb8

デバイス ブート      始点        終点     ブロック   Id  システム
/dev/sda1   *        2048     2099199     1048576   83  Linux
/dev/sda2         2099200    62914559    30407680   83  Linux

Disk /dev/mapper/centos-root: 7511 MB, 7511998464 bytes, 14671872 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト


Disk /dev/mapper/centos-swap: 4294 MB, 4294967296 bytes, 8388608 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト


Disk /dev/mapper/centos-opt: 3221 MB, 3221225472 bytes, 6291456 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト


Disk /dev/mapper/centos-var: 3221 MB, 3221225472 bytes, 6291456 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト


Disk /dev/mapper/centos-home: 2147 MB, 2147483648 bytes, 4194304 sectors
Units = sectors of 1 * 512 = 512 bytes
Sector size (logical/physical): 512 bytes / 512 bytes
I/O サイズ (最小 / 推奨): 512 バイト / 512 バイト

[root@homeserver ~]# 

OS再起動

[root@homeserver ~]# shutdown -r now

物理ボリュームのリサイズ

sda2をリサイズします。

[root@homeserver ~]# pvresize /dev/sda2
  Physical volume "/dev/sda2" changed
  1 physical volume(s) resized or updated / 0 physical volume(s) not resized
[root@homeserver ~]# pvdisplay  --- Physical volume ---  PV Name               /dev/sda2
  VG Name               centos
  PV Size               <29.00 GiB / not usable 2.00 MiB
  Allocatable           yes
  PE Size               4.00 MiB
  Total PE              7423
  Free PE               2560
  Allocated PE          4863
  PV UUID               MLSbDZ-yoIj-Q2TK-u67C-DNav-uze1-96ubHI

論理ボリュームのリサイズ

/varを拡張します。
まず、論理ボリュームの現状を確認します。

[root@homeserver ~]# lvdisplay
  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/centos/root
  LV Name                root
  VG Name                centos
  LV UUID                e6eAUN-vVUg-rT2j-8xJ9-Lyis-MJpc-Ly2OMD
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time localhost, 2019-10-26 18:05:48 +0900
  LV Status              available
  # open                 1
  LV Size                <7.00 GiB
  Current LE             1791
  Segments               1
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     8192
  Block device           253:0

  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/centos/opt
  LV Name                opt
  VG Name                centos
  LV UUID                az5Mbs-6pzv-u2gZ-l2uS-GraP-lHan-YH3wd6
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time localhost, 2019-10-26 18:05:49 +0900
  LV Status              available
  # open                 1
  LV Size                3.00 GiB
  Current LE             768
  Segments               1
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     8192
  Block device           253:2

  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/centos/var
  LV Name                var
  VG Name                centos
  LV UUID                uNalEu-11ti-Sfwy-WXNJ-gfP6-s1T3-4JGuhw
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time localhost, 2019-10-26 18:05:49 +0900
  LV Status              available
  # open                 1
  LV Size                3.00 GiB
  Current LE             768
  Segments               1
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     8192
  Block device           253:3

  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/centos/home
  LV Name                home
  VG Name                centos
  LV UUID                Qz23bu-97Hp-URdR-hCgR-iNF0-6RiS-gNDseY
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time localhost, 2019-10-26 18:05:49 +0900
  LV Status              available
  # open                 1
  LV Size                2.00 GiB
  Current LE             512
  Segments               1
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     8192
  Block device           253:4

  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/centos/swap
  LV Name                swap
  VG Name                centos
  LV UUID                1w66Oz-Ugnv-uHET-uVBc-lUNH-j1g7-4pZlR9
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time localhost, 2019-10-26 18:05:50 +0900
  LV Status              available
  # open                 2
  LV Size                4.00 GiB
  Current LE             1024
  Segments               1
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     8192
  Block device           253:1

[root@homeserver ~]#

次に、fstabを確認し、拡張する対象のマッピングを確認します。
(1列目のところです。)

[root@homeserver ~]# cat /etc/fstab

#
# /etc/fstab
# Created by anaconda on Sat Oct 26 18:05:52 2019
#
# Accessible filesystems, by reference, are maintained under '/dev/disk'
# See man pages fstab(5), findfs(8), mount(8) and/or blkid(8) for more info
#
/dev/mapper/centos-root /                       xfs     defaults        0 0
UUID=e66291ed-c31b-4342-a63e-d87425167639 /boot                   xfs     defaults        0 0
/dev/mapper/centos-home /home                   xfs     defaults        0 0
/dev/mapper/centos-opt  /opt                    xfs     defaults        0 0
/dev/mapper/centos-var  /var                    xfs     defaults        0 0
/dev/mapper/centos-swap swap                    swap    defaults        0 0
[root@homeserver ~]#

lvextendコマンドより増やしたサイズ分を拡張します。

[root@homeserver ~]# lvextend -L+10G /dev/centos/var
  Size of logical volume centos/var changed from 3.00 GiB (768 extents) to 13.00 GiB (3328 extents).
  Logical volume centos/var successfully resized.
[root@homeserver ~]#

lvdisplayコマンドより確認しますが、反映はされません。

[root@homeserver ~]# lvdisplay
  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/centos/root
  LV Name                root
  VG Name                centos
  LV UUID                e6eAUN-vVUg-rT2j-8xJ9-Lyis-MJpc-Ly2OMD
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time localhost, 2019-10-26 18:05:48 +0900
  LV Status              available
  # open                 1
  LV Size                <7.00 GiB
  Current LE             1791
  Segments               1
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     8192
  Block device           253:0

  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/centos/opt
  LV Name                opt
  VG Name                centos
  LV UUID                az5Mbs-6pzv-u2gZ-l2uS-GraP-lHan-YH3wd6
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time localhost, 2019-10-26 18:05:49 +0900
  LV Status              available
  # open                 1
  LV Size                3.00 GiB
  Current LE             768
  Segments               1
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     8192
  Block device           253:2

  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/centos/var
  LV Name                var
  VG Name                centos
  LV UUID                uNalEu-11ti-Sfwy-WXNJ-gfP6-s1T3-4JGuhw
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time localhost, 2019-10-26 18:05:49 +0900
  LV Status              available
  # open                 1
  LV Size                13.00 GiB
  Current LE             3328
  Segments               2
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     8192
  Block device           253:3

  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/centos/home
  LV Name                home
  VG Name                centos
  LV UUID                Qz23bu-97Hp-URdR-hCgR-iNF0-6RiS-gNDseY
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time localhost, 2019-10-26 18:05:49 +0900
  LV Status              available
  # open                 1
  LV Size                2.00 GiB
  Current LE             512
  Segments               1
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     8192
  Block device           253:4

  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/centos/swap
  LV Name                swap
  VG Name                centos
  LV UUID                1w66Oz-Ugnv-uHET-uVBc-lUNH-j1g7-4pZlR9
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time localhost, 2019-10-26 18:05:50 +0900
  LV Status              available
  # open                 2
  LV Size                4.00 GiB
  Current LE             1024
  Segments               1
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     8192
  Block device           253:1

[root@homeserver ~]#
[root@homeserver ~]# df -h
ファイルシス            サイズ  使用  残り 使用% マウント位置
/dev/mapper/centos-root   7.0G  2.5G  4.6G   36% /
devtmpfs                  475M     0  475M    0% /dev
tmpfs                     487M     0  487M    0% /dev/shm
tmpfs                     487M  7.7M  479M    2% /run
tmpfs                     487M     0  487M    0% /sys/fs/cgroup
/dev/sda1                1014M  133M  882M   14% /boot
/dev/mapper/centos-var    3.0G  1.6G  1.5G   51% /var
/dev/mapper/centos-home   2.0G   33M  2.0G    2% /home
/dev/mapper/centos-opt    3.0G   33M  3.0G    2% /opt
tmpfs                      98M     0   98M    0% /run/user/0

実際に反映するには、xfs_growfsが必要です。
なので、xfs_growfsを行います。

[root@homeserver ~]# xfs_growfs /dev/mapper/centos-var
meta-data=/dev/mapper/centos-var isize=512    agcount=4, agsize=196608 blks
         =                       sectsz=512   attr=2, projid32bit=1
         =                       crc=1        finobt=0 spinodes=0
data     =                       bsize=4096   blocks=786432, imaxpct=25
         =                       sunit=0      swidth=0 blks
naming   =version 2              bsize=4096   ascii-ci=0 ftype=1
log      =internal               bsize=4096   blocks=2560, version=2
         =                       sectsz=512   sunit=0 blks, lazy-count=1
realtime =none                   extsz=4096   blocks=0, rtextents=0
data blocks changed from 786432 to 3407872
[root@homeserver ~]#
[root@homeserver ~]# df -h
ファイルシス            サイズ  使用  残り 使用% マウント位置
/dev/mapper/centos-root   7.0G  2.5G  4.6G   36% /
devtmpfs                  475M     0  475M    0% /dev
tmpfs                     487M     0  487M    0% /dev/shm
tmpfs                     487M  7.7M  479M    2% /run
tmpfs                     487M     0  487M    0% /sys/fs/cgroup
/dev/sda1                1014M  133M  882M   14% /boot
/dev/mapper/centos-var     13G  1.6G   12G   12% /var
/dev/mapper/centos-home   2.0G   33M  2.0G    2% /home
/dev/mapper/centos-opt    3.0G   33M  3.0G    2% /opt
tmpfs                      98M     0   98M    0% /run/user/0

この設定を行うことで、実体ファイル容量の増加に伴う、/varの逼迫は解消します。

以上です。

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