最近(2022/05末〜本記事投稿時点）、FreeBSD ports の autoconf 関連
autoconf: 2.69_3
autoconf-wrapper: 20131203
は、portmaster を用いても自動的に更新されません。
これらは、 それぞれ
autoconf: 2.71
autoconf-switch: 20220527
に置き換えられるものですが、ports-mgmt/portmaster を用いても失敗してしまいます。
対処法
手動で以下のコマンドを打つ他ないと思われます。
pkg remove auto\*
本文書期限
そのうち改善されると思うので、来月には改善されているか待ちます。