GitHubのREADMEページにリンクがある場合、クリックすると同じタブで開かれます。これはMarkdown内に生のHTMLを書いてtarget="_blank"属性を追加しても解決しないようです。そこで、JavaScriptでaタグにtarget="_blank"属性を追加するようなユーザースクリプトを作成しました。

Chromeに拡張機能Tampermonkeyを追加し、以下のスクリプトを追加すれば良いです。

// ==UserScript==
// @name         GitHub README open in a new tab
// @namespace
// @version      0.1
// @description 
// @author       You
// @match        https://github.com/*
// @grant        none
// ==/UserScript==

(function() {
    'use strict';

    let article = document.querySelector("article");
    if (article) {
        article.querySelectorAll("a").forEach(elem => {
            elem.setAttribute("target", "_blank");
        });
    }
})();