Rで系統樹を扱う(ape, ggtree)
Rで系統樹を扱うときに必要なapeやggtreeの使い方がどうしても覚えられないので軽くまとめました。 内容については随時追加予定です。 参考にしたサイト ggtree: Elegant Gra...
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RColorBrewer 16進数コードまとめ
色の16進数表記をいちいち出すのがめんどうなので、メモ の前に RColor Brewerでよく使うコマンド library(RColorBrewer) #全てのカラーパレットの表示 displ...
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R ⇄ python 対応シート(表計算系)
pythonをやっていて、Rで言うあの関数が使いたい！(逆も然り)となった時のためのメモです。 私はpythonがわからないのでpythonメインで、Rの中身は適当です。 例のためDataFra...
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[python] データ読み込み
pythonで使えるファイル読み込み方法をいくつかあげました。 どんな関数があったっけ、となった時用なので、各関数の詳しい説明は省いてます。 open() ファイルとモードを指定。 モードのデフ...
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Seurat v3.0 - Guided Clustering Tutorial
scRNA-seqの解析に用いられるRパッケージのSeuratについて、ホームページにあるチュートリアルに沿って解説（和訳）していきます。ちゃんと書いたら長くなってしまいました。 あくまで自分の...
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[UNIX] 複数ファイルの移動
ディレクトリ中の複数のファイルを一気に移動させたい場面に遭遇したのでまとめてみました。 ある規則に沿ってまとめる 数で区切ってまとめる の方法があります。(私は2の方がやりたかった、、) 1. ...
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