遺伝子ごとにUTR長やGC含量を取得する方法
はじめに RNA-seqなどのデータを眺めていて、得られた発現変動遺伝子のGC含量やUTRの長さなどの情報を調べたくなることがあったのでその方法をまとめる。 動機についてもう少し詳しく 遺伝子の...
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ggplot2で異なるフォントサイズを含む軸ラベルやグラフタイトルを書く方法
はじめに ggplot2でグラフを作図していて、軸のラベルやグラフタイトルなどにフォントサイズの違う文字を含む文を書きたいことがある。 例として、以下のコードで作図したグラフを考えてみる。 li...
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Transcriptごとに各領域のGC含量とG/C ending codonの割合を算出したい
はじめに 前回書いた記事で遺伝子ごとにUTR長やGC含量を取得する方法を書いた。その時に利用したデータベースの情報では、GC含量(percentage_gene_gc_content)はtran...
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