次世代シークエンスのdry解析においてduplicate readsは取り除かれるべきか
##はじめに これは個人用に調べたメモ書きです。誤りを含んでいる可能性があります。問題点があればご指摘いただけますと幸いです。 ##序論 次世代シークエンスの解析においてfastqcなどでrea...
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Deep Learningで文章をNERする(AIで暗記を効率化する)
google colab コード 概要 今回はdeep learningを用いたモデルに文章を与えて、その文章の特定のキーワードだけmaskingすることを目指しました。 例えば、多くの人は...
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【Pytorch】kaggle notebookでPytorchのGPUのコードをTPUのコードに書き換える【GPU→TPU】
0,はじめに 下記を書き換えることで、2021年11月19日現在は動作することを確認しましたが、cudaのversionなどの問題で動作しなくなることがあります。 その場合はおそらくpytorc...
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scanpyのデータ統合関数(sc.tl.ingest)を使ってみる
※2021年5月24日追記 東京大学定量生命科学研究所 大規模生命情報解析研究分野の中戸先生の研究室がホームページでscanpyのチュートリアルを和訳されたものを公開されていらっしゃいます。(s...
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複数枚のHEIC画像をまとめて一つのPDFファイルに変換する(Python)
概要 iPhoneで撮影した授業の板書の画像にgoodnotes5で書き込みをしたい。 しかも、一つの科目につき複数枚の写真を撮るのでそれらは一つのノートにまとめたい。 iPhoneからMacに...
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