bundle install や bundle update したら
WARN: Unresolved or ambiguous specs during Gem::Specification.reset:
といった警告が出ることがある。
これについて調べた（未解決）。
環境
% ruby -v
ruby 3.4.8 (2025-12-17 revision 995b59f666) +PRISM [arm64-darwin25]
% gem -v
4.0.7
% bundle -v
4.0.7
% gem list psych
*** LOCAL GEMS ***
psych (5.3.1, default: 5.2.2)
全て記事執筆時点の最新の状態である。
再現手順
空のディレクトリーで
bundle init
する。
Gemfile のひな形が出来る。
Gemfile に何か一つ gem を記載する。
# frozen_string_literal: true
source "https://rubygems.org"
gem "date"
ここでは標準添付ライブラリーの date gem を書いてみたが，添付ライブラリーではない zeitwerk とか rubyzip とかでもいい。
bundle install する：
% bundle install
Fetching gem metadata from https://rubygems.org/.
Resolving dependencies...
WARN: Unresolved or ambiguous specs during Gem::Specification.reset:
psych (>= 4.0.0)
Available/installed versions of this gem:
- 5.3.1
- 5.2.2
WARN: Clearing out unresolved specs. Try 'gem cleanup <gem>'
Please report a bug if this causes problems.
Bundle complete! 1 Gemfile dependency, 1 gem now installed.
Use `bundle info [gemname]` to see where a bundled gem is installed.
成功しているのだが，psych のバージョンに関して何か警告が出ている。
psych は Gemfile に記載した gem とは関係ない（依存 gem でもない）のだが，なぜこんな警告が出るのか。
他の Bundler コマンドでは
bundle check では警告は出ないようだ。
bundle update では出る。
（今の Bundler では bundle update に --all オプションを付けないと別の警告も出るが，本題と関係ないので本記事では略す）
Gemfile.lock が存在している状態での bundle install では警告は出ない。
psych を整理したら
警告メッセージには
psych (>= 4.0.0)
Available/installed versions of this gem:
- 5.3.1
- 5.2.2
とあり，
Try 'gem cleanup '
とある。
しかし，インストールされている psych のうち古いほう（5.2.2）は default gem なので，
gem cleanup psych
とやったところで何も起こらない。
では新しいほうを削除したどうなるか。
→警告は出なくなった。
Gemfile に psych を入れたら
psych は使ってないのだが，バージョンが曖昧だとか言っているので，Gemfile に gem "psych" を入れてみたどうだろう。
まず，バージョン指定なしで：
gem "psych"
→警告は出る。
では，新しいほうをあらわに指定：
gem "psych", "5.3.1"
→警告は出る。
古いほうをあらわに指定：
gem "psych", "5.2.2"
→やはり警告は出る。
しかも，default gem の 5.2.2 があるにもかかわらず，bundle install や bundle update で 5.2.2 がもう一つインストールされるというワケの分からないことが起こる。
issue は？
このへんが類似の問題を扱っているが，読んでもよく分からない。
https://github.com/ruby/rubygems/issues/7657
https://github.com/ruby/rubygems/issues/2886