パッケージの更新

sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade

ソースのダウンロード

sudo apt-get install git
cd ; mkdir tmp ; cd tmp
git clone https://github.com/Itseez/opencv
git clone https://github.com/Itseez/opencv_contrib.git

ダウンロードに時間がかかるのでコーヒーでも飲みながら待つ．

CUDAのインストール

NVIDIAのグラボを詰んでるマシンなので，CUDAもインストールしておきます．

OpenCVのビルドに必要なパッケージのインストール

sudo apt-get build-dep opencv

でいけますが，まっさらなUbuntuだとソースが指定されていないぞと怒られるので，/etc/apt/sources.listの以下の行のコメントを外しておきます．
deb-src http://jp.archive.ubuntu.com/ubuntu/ xenial universe
ついでに
sudo apt-get update
してから，改めて
sudo apt-get build-dep opencv
します．
ここでnvidia-opencl-devが入っているとパッケージが削除されてocl-icd-opencl-devが代わりに入るので，nvidia-opencl-devを再度インストールしました（これでいいのかは自信なし）．
sudo apt-get install nvidia-opencl-dev

不要かもしれないけどVTKとGlogをインストール．
sudo apt-get install libvtk6-qt-dev libgoogle-glog-dev

CMakeLists.txtの修正

このままmakeするとmemcpy関係でコンパイルエラーが出るので，~/tmp/opencv/CMakeLists.txtを編集して，先頭に以下を追加
set(CMAKE_CXX_FLAGS "-D_FORCE_INLINES ${CMAKE_CXX_FLAGS}")

make

cd ~/tmp/opencv
mkdir build ; cd build
cmake -D WITH_TBB=ON -D OPENCV_EXTRA_MODULES_PATH=../../opencv_contrib/modules/ ..
＃CUDAインストールしてたので実際は，
cmake -D WITH_CUBLAS=ON -D WITH_TBB=ON -D OPENCV_EXTRA_MODULES_PATH=../../opencv_contrib/modules/ ..
make -j
sudo make install

makeには時間かかるのでおやつでも食べに行きましょう．

使用例はまたそのうちに．