起きた問題
zshはPythonのトレースバックメッセージが表示され、vim（私の場合SpaceVim）がinsertしようとすると、大量にエラーを吐かれて使いものにならなかった。vimの方のエラー内容は忘れてしまいました...
解消方法
Pythonのバージョンを3.6.0に戻してプラグインをそれぞれ再インストールしました。
vim
私はSpaceVimを使っているので、vimを開いて、:SPUpdateを行いました。
zsh
zplugでプラグインを管理しているため、zplug updateで再インストール
上記で解決しました。
かなり内容が薄くなってしまいましたが、とりあえずバージョンを戻せば元のように動くようになるようです