【自動化】PDF内の表をPythonで抜き出す

PDFは扱いにくい

PDFファイルをPythonで扱うのは大変です。

表がPDFの中に埋め込まれているケースも割とあります。

例えば

平成30年 全衛連ストレスチェックサービス実施結果報告書の中にはたくさんの表データが埋め込まれています。

例えばファイルの40ページの【表14 業種別高ストレス者の割合】を抜き出したいと思ったとします。

この表を選択して、Excelにコピペしてみましょう。

コピーして、Excelに貼り付けます。

おや？うまくいかないですね。
1つのセルの中に、全部のデータが羅列されてしまっています。

実はPythonを使ってこのPDF中の表を比較的簡単にcsvやExcelに変換することができます。

PythonでPDFの表をcsvに

PythonでPDF内の表(テーブル)をcsvやexcelに変換する手順は2ステップです。

ステップ1. PDFから表をpandasのDataFrameとして抜き出す
ステップ2. DataFrameをcsvやexcelとして書き込む

順に見ていきましょう。

ステップ1. PDFから表をpandasのDataFrameとして抜き出す

pdfの表をDataFrameとして抜き出すために、tabulaというモジュールを使います。

tabulaはインストールされていない方も多いと思いますので
pip install tabula-py
でインストールします。

さらにこのtabulaはJavaで動きますので、Javaのインストールも必要です。

tabulaの準備ができたところで、pandasとtabulaをimportしておきます。

python

import pandas as pd
import tabula

PDFから表を抜き出すには、
tabula.read_pdf("xxx.pdf", lattice=True, pages='xxxx')
という関数を使います。

※補足：tabula.read_pdf("xxx.pdf", lattice=True, pages='xxxx')でエラーになる場合もあるようです。その場合は、tabula.io.read_pdf("xxx.pdf", lattice=True, pages='xxxx')としてみてください。

• "xxx.pdf"には、読み込みたいPDFファイルのパスを書きます。

• lattice=Trueはテーブルの罫線でセルを判定するためのオプションです。
  抜き出したい表が罫線で区切られているならlattice=Trueを指定しましょう。

• pagesは読み込みたいページを指定します。

• 40ページ目だけを読み込むならpages='40'のように指定します。

• 40～45ページを読み込むならpages='40-45'のように指定します。

• すべてのページを読み込むならpages='all'でOKです。

• 関数の戻りとしてpandas.DataFrameのリストが返ります。複数の表があった場合には、このリストをfor文で順に取り出せばよいです。

では、先ほどの『平成30年 全衛連ストレスチェックサービス実施結果報告書』の40ページの表を読み込んでみましょう。

python

# lattice=Trueでテーブルの軸線でセルを判定
dfs = tabula.read_pdf("平成30年 全衛連ストレスチェックサービス実施結果報告書.pdf", lattice=True, pages = '40')

for df in dfs:
    display(df)

列名がセル内で改行されていたために\rが入ってしまっていて変ですが、表の中身はうまく取り出せていますね。

一応、列名もきちんと直しておきましょう。
df.rename(columns={'元の列名': '変更後の列名'})で列名を変更できます。
複数の列名を変更するときは'元の列名': '変更後の列名'をコンマで区切ってつなげていけばOKです。

python

df = df.rename(columns={'高ストレ\rス者数': '高ストレス者数', '高ストレス\r者の割合': '高ストレス者の割合'})

ステップ2. DataFrameをcsvやexcelとして書き込む

pandasには元々DataFrameをcsvやExcelとして書き込む機能がついています。

csvとして保存：df.to_csv("ファイル名.csv", index=None)
Excelとして保存：df.to_excel("ファイル名.xlsx", index=None)

※index=NoneはDataFrameのindexを書き込まないようにするためのオプション

まとめ

最後に今回のコードをまとめて記載しておきます。

pyhon

import pandas as pd
import tabula
 
# lattice=Trueでテーブルの軸線でセルを判定
dfs = tabula.read_pdf("平成30年 全衛連ストレスチェックサービス実施結果報告書.pdf", lattice=True, pages = '40')

# PDFの表をちゃんと取得できているか確認
for df in dfs:
    display(df)

# csv/Excelとして保存(今回はdfs[0]のみ)
df = dfs[0].rename(columns={'高ストレ\rス者数': '高ストレス者数', '高ストレス\r者の割合': '高ストレス者の割合'})
df.to_csv("PDFの表.csv", index=None) # csv
df.to_excel("PDFの表.xlsx", index=None) # Excel

画像扱いのPDFファイルから表を抜き出すには

紙の文書や書籍をスキャンして電子化したPDFの場合、テキストがOCR化されておらず、PDFファイル内の表が画像扱いのままのものもあると思います。

その場合は、下記の記事で紹介した方法をお試しください。

画像ファイルの表をOneDrive&Pythonで抜き出す

参考

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