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GalaxyAdvent Calendar 2017

Day 16
@percipere

Galaxyでタブ区切りをカンマ区切りに変換してみよう

Last updated at Posted at 2017-12-15

Galaxyを利用してカンマをタブに変更する手順

データをGalaxyから取り出して利用する時に、カンマ区切りのcsvファイルの方が都合が良いという場合が有る
そんな場合に備えて、タブで区切られているデータをカンマ区切りに変更してみよう

左側の"Tool"領域の"SQL tools"をクリック
Screen Shot 2017-12-15 at 18.41.40.png

表示される"Tabular to CSV"をクリック
Screen Shot 2017-12-15 at 18.41.53.png

"File(tabular)"フィールドのドロップダウンリストでファイルやデータを指定
Screen Shot 2017-12-15 at 18.42.45.png

"Execute"をクリックして実行
Screen Shot 2017-12-15 at 18.42.45.png

右側の"History"領域で、作成されたデータの目玉アイコンをクリック
Screen Shot 2017-12-15 at 18.42.50.png

テキストのタブがカンマに変換されている
Screen Shot 2017-12-15 at 18.42.59.png

今日はここまで:smiley:

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