innoSetupというソフトを使って、インストーラーを作成し、Windows上での配布ファイルを1つにまとめる方法について以下のYouTube動画で解説しました。
https://youtu.be/dUl2f-EkO48

まずは以下のページよりinnosetup-6.1.2.exeをダウンロードします。(2021年5月時点)
Download Siteという項目で、USというのを選択してあげると良いと思います。
https://jrsoftware.org/isdl.php

innoSetupのインストールが終わると、以下のようなソフトが起動します。
起動したら、コードを入力するフィールドがあるので、そこにコードを入力してあげます。コードを入力し終わったら、緑色の実行ボタンを押してあげるとインストーラーが作成されます。

動画内で実際に使用しているコードが以下の通りです。
コメントで解説するのは大変なので、詳しい解説は動画でご覧ください。

; Script generated by the Inno Setup Script Wizard.
; SEE THE DOCUMENTATION FOR DETAILS ON CREATING INNO SETUP SCRIPT FILES!

#define MyAppName "iFacialMocap" //書き換えるポイント①　アプリ名を変更
#define MyAppVersion "1.12"　//書き換えるポイント②　アプリのバージョンを変更
#define MyAppPublisher "Yasushi Emoto"　//書き換えるポイント③　自分の名前を入れる
#define MyAppURL "https://ifacialmocap.com/"　//書き換えるポイント④　アプリのURL
#define MyAppExeName "iFacialMocap.exe" //書き換えるポイント⑤　実行ファイルの名前

[Setup]
; NOTE: The value of AppId uniquely identifies this application. Do not use the same AppId value in installers for other applications.
; (To generate a new GUID, click Tools | Generate GUID inside the IDE.)
AppId={{xxxxx-xxxxx-xxxx-xxx-xxxxxxx}
AppName={#MyAppName}
AppVersion={#MyAppVersion}
;AppVerName={#MyAppName} {#MyAppVersion}
AppPublisher={#MyAppPublisher}
AppPublisherURL={#MyAppURL}
AppSupportURL={#MyAppURL}
AppUpdatesURL={#MyAppURL}
DefaultDirName={autopf}\{#MyAppName}
DisableProgramGroupPage=yes
; Uncomment the following line to run in non administrative install mode (install for current user only.)
;PrivilegesRequired=lowest
OutputDir=C:\Users\emoto\Desktop
OutputBaseFilename=iFacialMocapSetup
Compression=lzma
SolidCompression=yes
WizardStyle=modern

[Code]

/////////////////////////////////////////////////////////////////////
function GetUninstallString(): String;
var
  sUnInstPath: String;
  sUnInstallString: String;
begin
  sUnInstPath := ExpandConstant('Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Uninstall\{#emit SetupSetting("AppId")}_is1');
  sUnInstallString := '';
  if not RegQueryStringValue(HKLM, sUnInstPath, 'UninstallString', sUnInstallString) then
    RegQueryStringValue(HKCU, sUnInstPath, 'UninstallString', sUnInstallString);
  Result := sUnInstallString;
end;


/////////////////////////////////////////////////////////////////////
function IsUpgrade(): Boolean;
begin
  Result := (GetUninstallString() <> '');
end;


/////////////////////////////////////////////////////////////////////
function UnInstallOldVersion(): Integer;
var
  sUnInstallString: String;
  iResultCode: Integer;
begin
// Return Values:
// 1 - uninstall string is empty
// 2 - error executing the UnInstallString
// 3 - successfully executed the UnInstallString

  // default return value
  Result := 0;

  // get the uninstall string of the old app
  sUnInstallString := GetUninstallString();
  if sUnInstallString <> '' then begin
    sUnInstallString := RemoveQuotes(sUnInstallString);
    if Exec(sUnInstallString, '/SILENT /NORESTART /SUPPRESSMSGBOXES','', SW_HIDE, ewWaitUntilTerminated, iResultCode) then
      Result := 3
    else
      Result := 2;
  end else
    Result := 1;
end;

/////////////////////////////////////////////////////////////////////
procedure CurStepChanged(CurStep: TSetupStep);
begin
  if (CurStep=ssInstall) then
  begin
    if (IsUpgrade()) then
    begin
      UnInstallOldVersion();
    end;
  end;
end;

[Languages]
Name: "english"; MessagesFile: "compiler:Default.isl"
Name: "armenian"; MessagesFile: "compiler:Languages\Armenian.isl"
Name: "brazilianportuguese"; MessagesFile: "compiler:Languages\BrazilianPortuguese.isl"
Name: "catalan"; MessagesFile: "compiler:Languages\Catalan.isl"
Name: "corsican"; MessagesFile: "compiler:Languages\Corsican.isl"
Name: "czech"; MessagesFile: "compiler:Languages\Czech.isl"
Name: "danish"; MessagesFile: "compiler:Languages\Danish.isl"
Name: "dutch"; MessagesFile: "compiler:Languages\Dutch.isl"
Name: "finnish"; MessagesFile: "compiler:Languages\Finnish.isl"
Name: "french"; MessagesFile: "compiler:Languages\French.isl"
Name: "german"; MessagesFile: "compiler:Languages\German.isl"
Name: "hebrew"; MessagesFile: "compiler:Languages\Hebrew.isl"
Name: "icelandic"; MessagesFile: "compiler:Languages\Icelandic.isl"
Name: "italian"; MessagesFile: "compiler:Languages\Italian.isl"
Name: "japanese"; MessagesFile: "compiler:Languages\Japanese.isl"
Name: "norwegian"; MessagesFile: "compiler:Languages\Norwegian.isl"
Name: "polish"; MessagesFile: "compiler:Languages\Polish.isl"
Name: "portuguese"; MessagesFile: "compiler:Languages\Portuguese.isl"
Name: "russian"; MessagesFile: "compiler:Languages\Russian.isl"
Name: "slovak"; MessagesFile: "compiler:Languages\Slovak.isl"
Name: "slovenian"; MessagesFile: "compiler:Languages\Slovenian.isl"
Name: "spanish"; MessagesFile: "compiler:Languages\Spanish.isl"
Name: "turkish"; MessagesFile: "compiler:Languages\Turkish.isl"
Name: "ukrainian"; MessagesFile: "compiler:Languages\Ukrainian.isl"

[Tasks]
Name: "desktopicon"; Description: "{cm:CreateDesktopIcon}"; GroupDescription: "{cm:AdditionalIcons}"; Flags: unchecked

[Files]
//書き換えるポイント⑦　実行ファイルのある場所を指定
Source: "C:\Users\emoto\Documents\hold\iFacialMocapDevelop\dist\iFacialMocap\iFacialMocap.exe"; DestDir: "{app}"; Flags: ignoreversion

//書き換えるポイント⑧　ユーザーに配布したいデータのルートフォルダを指定
Source: "C:\Users\emoto\Documents\hold\iFacialMocapDevelop\dist\iFacialMocap\*"; DestDir: "{app}"; Flags: ignoreversion recursesubdirs createallsubdirs

//書き換えるポイント⑨　ユーザーに配布したいデータのフォルダが他にもあったら指定
Source: "C:\Users\emoto\Documents\hold\iFacialMocapDevelop\iFacial_connectScripts\*"; DestDir: "{app}\iFacial_connectScripts"; Flags: ignoreversion recursesubdirs createallsubdirs

//書き換えるポイント⑩　ユーザーに配布したいファイルが他にもあったら指定
Source: "C:\Users\emoto\Documents\hold\iFacialMocapDevelop\Acknowledgments.txt"; DestDir: "{app}\Acknowledgments.txt"; Flags: ignoreversion recursesubdirs

//書き換えるポイント⑪　WindowsのAppDataフォルダにコピーしたいフォルダがあれば指定                                          
Source: "C:\Users\emoto\Documents\hold\iFacialMocapDevelop\unity_standaloneData\*";DestDir: "{userappdata}\iFacialMocap\unity_standaloneData";Flags: ignoreversion recursesubdirs createallsubdirs

//書き換えるポイント⑫　ユーザーに配布したいフォルダで、アンインストール後にも削除したくない(ユーザー設定などの)フォルダがあれば指定してAppDataフォルダにコピー
Source: "C:\Users\emoto\Documents\hold\iFacialMocapDevelop\settingFiles\*"; \
    DestDir: "{userappdata}\iFacialMocap\settingFiles"; \
    Flags: ignoreversion recursesubdirs createallsubdirs \
           onlyifdoesntexist uninsneveruninstall
; NOTE: Don't use "Flags: ignoreversion" on any shared system files

[Icons]
Name: "{autoprograms}\{#MyAppName}"; Filename: "{app}\{#MyAppExeName}"
Name: "{autodesktop}\{#MyAppName}"; Filename: "{app}\{#MyAppExeName}"; Tasks: desktopicon

[Run]
Filename: "{app}\{#MyAppExeName}"; Description: "{cm:LaunchProgram,{#StringChange(MyAppName, '&', '&&')}}"; Flags: nowait postinstall skipifsilent

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