必要な箇所を切り出す

①パスの読込み

<?php include('ファイルのパス'); ?>

例えば、2階層上のcommon配下に設置。

<?php include('../../common/include/header.php'); ?>

<?php
    $path = "../../";
?>

　または、


<?php
    $path = "../";
?>

　等々、そのhtmlの、ルートからのパスを設定。

※これをしておくと、ほかのrelで読み込むcss/js等のパスの記述についても、<?=$path?> で簡素化することもできる。　

<?php include($path . 'common/include/header.php'); ?>

以上。
①と②はセットで運用必至。

これで、いろんな階層のhtmlファイルに、共通パーツを設置することが可能に！