TL;DR

振電３なら，配布されているものの.exeファイルを以下の実行ファイルに変えることで動かせます．

Android上のフォルダ配置は以下です．

.
└── ShogiDroid/
    └── engine/
        ├── Shinden3/
        │   ├── eval/nn.bin
        │   ├── book/standard_book.db
        │   ├── Yane~
        │   └── Yane~
        └── Suisho5(例)/
            ├── eval/
            ├── book/
            ├── Yane~
            └── Yane~

解凍したShinden3のフォルダを圧縮して「アプリからインストール」しようとすると失敗します！！ 必ず，上のようなフォルダ配置になるように手動で配置してください．

詳細

本家YaneuraOuをフォークした

を参照してください．Android用のビルドに用いるAndroid.mkファイルを書き換えて，事前定義されていないNNUEアーキテクチャ（e.g. 振電３，Suisho10beta，ポンタマンなど）のヘッダーを作成するショートカットコマンドndk-build make_nnue_headerを追加したものになっています．

ビルド環境に必要なもの，ビルドの仕方の基本については本家Wiki/ やねうら王のビルド手順に非常に詳しく書いてあります．また，各評価関数に必要なアーキテクチャについても，本家Wiki/ やねうら王のインストール手順#評価関数のタイプ一覧表に記載されています．

本家やねうら王のビルド環境と，ndk-buildの使える環境を整えた上で，例えば

ndk-build make_nnue_header YANEURAOU_EDITION=YANEURAOU_ENGINE_NNUE_HALFKP_512X2_8_64
ndk-build YANEURAOU_EDITION=YANEURAOU_ENGINE_NNUE_HALFKP_512X2_8_64

とすることで，事前にヘッダの用意されていないアーキテクチャに対応するエンジンをビルドすることができます．

参考

M1Macへの導入方法の動画
ShogiDroidの作者様の作った，Android.mk（本家やねうら王に反映済み）

蛇足

いまどきarm64-v8aでないShogiDroidを動かせるようなスマホがあるのか疑問なんですが，アプリ配布するわけでもないので，arm64-v8aだけにしてtournament版にも対応できた方が嬉しい気がする．しらんけど．