pythonからpyperを使ってRを実行し、出力グラフ画像をbase64取得

はじめに

pandasのデータフレームと連携する形での記述。
最近確実に需要のない記事ばっかり、、(;´Д｀)

環境

• windows10
• python 3.9.4
• R 4.12

pip

pip install pyper

R(package)

install.packages("ggplot2")
install.packages("shiny", dependencies = TRUE)

※何らかの形でggplot2とshinyをインストールすればよいかと
※shinyはbase64のエンコードに必要

コード

import pyper
import numpy
import pandas

# ランダムデータフレーム作成
n = 100
randomArray = numpy.random.normal(0, 10, n)
df = pandas.DataFrame({"xData": randomArray})

# Rの実行オブジェクト作成
r = pyper.R()
# pandasのオブジェクトをRで扱えるようにする
r = pyper.R(use_pandas="True")
# 作成したデータフレームを設定
r.assign("p_df", df)

r(
    """
# ライブラリインポート
library(ggplot2)
library(shiny)

# グラフのプロットデータ作成
p <- ggplot(data = p_df,
      mapping = aes(x=xData)) +
      geom_density(fill = "gold")

# 画像出力(サイズは dpi*width × dpi*height のピクセルサイズとなる)
ggsave(filename = "sample.png",
       plot = p,
       device = "png",
       width = 6.4, height = 4.8,
       dpi = 100)

# base64変換
b64image <- base64enc::dataURI(file = "sample.png", mime = "image/png")
"""
)

# Rで変換した内容を取得
res = r.get("b64image")
# とりあえずは標準出力
print(res)

終わりに

shinyはbase64encだけ実行できれば良いとは思うんだけど、やたらサイズがデカい、、細かくパッケージインストールする方法とかbase64エンコードできるほかのパッケージとかあるかも、、