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結論

最終更新日時の確認
差分クロールを行う場合に有効にします。

公式ドキュメントには上記のように記載されているが、あくまでクロールを行った際にインデックスの作成を行うか否かの判定にのみ影響しているようで、クロール自体は対象パス内の全ファイルに対して行われている模様。
その為**「差分だから処理速度が速い」**ということはない。
（検証結果は後述）

得てして、差分クロールを求める背景には以下の要件があることと思われる。

結論として現在の Fess で上記のような差分クロールを行う為には**「ファイルクロール」ではなく、あらかじめクロール対象のファイル一覧を用意した上で「データストアクロール」**を使用することになると思われる。
（有識者の方、ベストプラクティスがあれば教えていただきたい）

検証

以下、3ステップにてクロール完了に要する時間を計測した。

C:/fess-search/dummy/ 配下に dummy0001.txt ～ dummy1000.txt を作成。
ファイルクロールを実施。

約4分弱で 1000ファイルのインデックス作成が完了。

dummy0100.txt の内容を変更（ファイル内に modify と追記）した後、ファイルクロールを実施。

約4分弱で変更された 1ファイルのインデックス作成が完了。初期 1000件クロールと同程度の処理時間を要した。

更新が反映されていることを確認。

データストアクロールの設定は以下を参考に実施。
https://fess.codelibs.org/ja/13.9/admin/dataconfig-guide.html

アクション、クロール対象を記載した CSV を C:/fess_crawl_list/ 配下に作成する。

/fess_crawl_list/update.csv

modify,file:/C:/fess-search/dummy/dummy0200.txt

クローラ＞データストア＞新規作成

インデクシング対象のファイルパスを記述した CSV ファイルをクロールする「CsvListDataStore」を使用する。

項目	設定値
名前	任意
ハンドラ名	CsvListDataStore
パラメーター	directories=C:/fess_crawl_list fileEncoding=UTF-8
スクリプト	event_type=cell1 url=cell2
ブースト値	1.0
パーミッション	{role}guest
状態	有効

dummy0200.txt の内容を変更（ファイル内に modify と追記）した後、データストアクロールを実施。

一瞬で変更された 1ファイルのインデックス作成が完了。

更新が反映されていることを確認。