例えば以下のような雰囲気で書いた。

        var command = {
            mapreduce:"communications",
            query:query,
            map:communicationCountMapFunc,
            reduce:communicationCountReduceFunc,
            out:'communications_mr_buf'
        };

        var dbh = new DPH(Promise); //これはPromiseをDB対応させるラッパ
        mongoose.connection.db.executeDbCommand(command, dbh.handler(function (ret) {
            return ret.documents[0];
        }));
        return dbh.promise;

後でcommunications_mr_bufテーブルから結果を引っ張って来ることになる。下記のように（ここをクールに書く方法は知りたい。モデルとして定義しないでも良い処理なので）。

                var dbh = new DPH(Promise);
                var CommunicationBufEntity = mongoose.model('communications_mr_buf', CommunicationBufSchema);//スキーマは別途定義しておいて。

                CommunicationBufEntity.find(query, {}, options, dbh.handler());
                return dbh.promise;

ただ、Mongooseのモデルの基本的なルールが、mongoose.modelの第一引数のオブジェクト名には's'が自動的に付与される動きだったので、communications_mr_bufsを検索してしまい、上記のままでは一件も引っかからない。

と言うわけで最初に出力するテーブルに's'を付けて回避した。おかげで数時間無駄にしてしまったのであった。クールな方法があったら知りたいです。