WebStorm起動時に画面左上に"PhoneGap/Cordova has incorrect executable path"と表示される場合は以下のように対応します。

Cordovaコマンドのパスを設定

メニューから"Preferences..."を選択して環境設定ダイアログを表示し、環境設定ダイアログの左メニューから"Languages & Frameworks"->"Javascript"->"Phonegap/Cordova"を選択します。
"PhoneGap/Cordova executable"のリストボックスからインストールされているCordovaの実行パスを選択します。(ionicでもOK）一覧に表示されない場合は、リストボックス右に"..."ボタンからファイル選択ダイアログを表示させインストールされているCordovaを選択します。
設定が完了したら面右下のOKボタンをクリックします。

PhoneGap/Corodovaプラグインを無効にする

そもそもCordovaを使っていないという場合は、"PhoneGap/Cordovaプラグイン"を無効にします。
メニューから"Preferences..."を選択して環境設定ダイアログを表示し、環境設定ダイアログの左メニューから"Plugins"を選択します。
表示されるプラグイン一覧の"PhoneGap/Cordova Plugin"右のチェックボックスをオフにして画面右下のOKボタンをクリックします。