Docker で Jupyter Notebook を使う（PostgreSQL と pgAdmin コンテナ同時起動）

Jupyter Notebook から DB へアクセスできるように、三つのコンテナ（Jupyter Notebook / PostgreSQL / pgAdmin）を同時に起動できる環境を構築します。

準備

プロジェクト用ディレクトリと各種ファイルを作成します。

$ mkdir my-anaconda && cd my-anaconda
$ touch Dockerfile docker-compose.yml

Dockerfile

FROM continuumio/anaconda3:latest

RUN useradd -d /home/[ユーザー名] -m -s /bin/bash [ユーザー名]

WORKDIR /home/[ユーザー名]/my-anaconda

RUN /opt/conda/bin/conda install jupyter -y --quiet
RUN pip install psycopg2-binary

docker-compose.yml

version: '3'

services:
  db:
    image: postgres:10.4
    container_name: postgres-my-anaconda
    volumes:
      - db-data:/var/lib/postgresql/data
    ports:
      - "5432:5432"

  pgadmin:
    image: dpage/pgadmin4
    container_name: pgadmin-my-anaconda
    volumes:
      - ./pgadmin:/var/lib/pgadmin
    ports:
      - "8000:80"
    depends_on:
      - db
    environment:
      PGADMIN_DEFAULT_EMAIL: postgres
      PGADMIN_DEFAULT_PASSWORD: postgres

  anaconda:
    build: .
    container_name: my-anaconda
    volumes:
      - .:/home/[ユーザー名]/my-anaconda
    ports:
      - "8080:8888"
    depends_on:
      - db
    tty: true
    command: >
      jupyter notebook
      --notebook-dir=/home/[ユーザー名]/my-anaconda
      --ip='0.0.0.0'
      --no-browser
      --allow-root
      --NotebookApp.token='jupyter'

volumes:
  db-data:

サービスのビルドとコンテナの作成

サービスをビルドします。

$ docker-compose build

コンテナを作成します。

$ docker-compose up -d

ブラウザからアクセスする

Jupyter Notebook

http://localhost:8080 にアクセスします。「Password or token」に「jupyter」と入力すれば Jupyter Notebook が表示されます。

pgAdmin

http://localhost:8000 にアクセスします。ログイン情報は、Email Address / Password ともに「postgres」です。

サービスの開始と停止

サービスを停止するには以下を実行します。

docker-compose stop

再度サービスを開始して Jupyter Notebook を使う場合は以下を実行します。

docker-compose start