こんにちは。
Sumbera/L.CanvasOverlay.js というものを見つけました。canvas layer を作り（overlay）、その上に点などを自前で描画表示します。
作者自身がその後、Leaflet 1.x 対応版を作ったようで、私の下記の仕事は不要となったようです。
これに少し手を加えて Leaflet 1.x で動くようにしました：
- kkdd/L.CanvasOverlay.js (bl.ocks.org)
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