#Javaプログラムを書く
##Eclipseのプロジェクト構成
プロジェクト構成はこんな感じです。

Hello.javaでなくてDebug.javaでした。スクリーンショットが間違っています。（私のミスです！）
Hello.javaではなく、以後もDebug.javaとして出てきますので、Debug.javaというクラスを作成してください。

##実行するJavaファイル
Javaファイル「Debug.java」の中身はこんな感じで。

Debug.java

package sample;

public class Debug {
	public static void main(String[] args) {
		System.out.println("");
		System.out.println("java引数　→ " + args[0]);
		String vmarg = System.getProperty("vmarg");
		System.out.println("VM引数 → " + vmarg);
	}
}

処理としてはmainへ渡す引数とVM引数の値をprintしているだけです。

#Javaを実行するバッチを書く

execute.bat

SET CONTEXT="C:\eclipse4.2\workspace\Debug"
SET REMOTE_DEBUG="-agentlib:jdwp=transport=dt_socket,address=8000,server=y,suspend=y"
call %JAVA_HOME%\bin\java.exe -cp %CONTEXT%\bin\ %REMOTE_DEBUG% -Dvmarg="HelloWorld_VMArg" sample.Debug "HelloWorld_JAVAARG"
pause

全部で４行です。
コピペしてもらえれば、ちゃんとペーストできると思います。
##１行目
このbatを置いてあるプロジェクトを変数CONTEXTにセット。
ステップ実行したいJavaファイルもこのディレクトリに置いています。
##２行目
REMOTE_DEBUG変数にJavaコマンド実行時に与えるリモートデバッグ用の引数をセットしています。
##３行目
####Javaクラス「Debug」を実行する部分です。

Javaコマンドの引数に-cpでクラスパスを指定。「%CONTEXT%\bin\」の部分。
２行目で設定したREMOTE_DEBUG変数を引数として指定。「%REMOTE_DEBUG%」の部分。
VM引数としてvmargという名前で文字列"HelloWorld_VMArg"を指定。
実行するJavaプログラムを指定「sample.Debug」の部分。
Javaプログラム「sample.Debug」の引数として文字列"HelloWorld_JAVAARG"を指定。

#batを実行する
execute.batを実行します。普通にダブルクリックすれば実行されますね。

こんな形で止まるはずです。

#Eclipseでリモートデバッグする
##設定の作成
パッケージエクスプローラのDebugプロジェクトを右クリック >> Debug As >> Debug Configurationで　
以下の画面のようにRemote Java Applicationを作成

##実行
あとはDebugボタンをポチればいいのですが、その前にDebug.javaにEclipseでブレークポイント入れておいてくださいね。
で、ポチ！
するとブレークポイントで止まります。

ステップ実行していくとコマンドプロンプトにprintデバック結果も表示されることでしょう。

なんか、かつかつで大規模なバッチプログラムとかprint文仕込んでデバックするのいやですよね。
あり得ないでしょう！

以上です。