【Unity】webgl向けにビルドしたときのvectorのずれを直す方法

現状

以下のソースを用いてprefabをインスタンス化しているのですが、Unity上で動かしたときとWeb上にアップロードした後でオブジェクトが作られる位置がずれてしまいます。
Unity上ではWebGLのデフォルトのサイズである960x600で作っており、index.htmlのstyleも960×600なのですがなぜずれてしまうのでしょうか？
また、直す方法はないでしょうか？

ソース
// prefabのkomaをインスタンス化する。
GameObject koma = (GameObject)Instantiate(obj,new Vector3(332,291.5,0),Quaternion.identity,komaParent);

▼Unity上で動かしたとき

▼Webサーバー上で動かしたとき