JetBrains Toolbox Appでは、

設定 > ツール > ツールのインストール場所

にて、ツールのインストール場所を変更できるはずなのですが、本稿執筆時点（JetBrains Toolbox 2.0.4.17212, macOS 13.4.1）においては、編集できません。

そこで、以下のIssueコメントにあるように、 ~/Library/Application\ Support/JetBrains/Toolbox/.settings.json の install_location に任意のパスを設定することで、インストール場所を変更できます。

以下は、 /Applications に設定する場合の例です。

{
  "install_location": "/Applications"
}