「tidyな分析環境つくるのがたいぎぃ」からDocker使う

これはRStudio Advent Calendar 2017とtidyポエム Advent Calendar 2017の22日目の記事です。クロスポストご容赦ください。

tidyたいぎぃ

「たいぎぃ」とは広島弁で「めんどくさい」とかそういうニュアンスの方言です。老若男女問わずに「あーもうこれやるんたいぎぃわー」といった感じで使ってます。なお私は広島県民になって20年以上経過しましたが，未だに無意識で「たいぎぃ」という言葉を発するまでには至ってません。「じゃけぇ」は使うのに。

閑話休題。Rで分析環境を整えようとするなら，少なくとも以下のような手順が必要になるかと思います:

1. マシンにRをインストール
   2. R本体をインストール
   3. (必要であれば)Rtoolsといったコンパイラをインストール
2. マシンにRStudioをインストール
3. Rを起動して必要なパッケージをインストール
   4. パッケージをCRANなどから持ってくる
   5. (必要に応じて)R外のライブラリなども入れる

結構面倒ですね。そしてtidyverseはパッケージが多く，いくらinstall.packages("tidyverse")で入れられるといえ，結構時間かかります。「たいぎぃ」です。

さらに，これがたったひとつのマシンならいざ知らず，複数台を所有(or管理)している，さらにOSもWin, Mac, Ubuntuなどバラバラだったらどうでしょう。これはもう「くそたいぎぃ」ですね。

というわけで，Dockerを利用します。

Dockerでtidyな分析環境を構築

DockerでR環境?

Dockerを利用してR+RStudioの分析環境を構築する方法や手順については，すでに私自身や他の方の記事がありますので，それらを紹介するに留めます。ぜひともRユーザーの方は一読をおすすめします:

• Reproducebility 100倍 Dockerマン
  • teramonagi氏によるスライド。tokyor/rstudioイメージの紹介
• Dockerを利用してrstanがすぐ使えるRStudio Serverの構築2017年版
  • rstanユーザー向けに準備したイメージの話。これの一つ前の話の方が解説おおいかも
• Rから離れたくない人向けのDocker環境の操作: RStudio Serverを分析・開発の基盤にするために - まだ厨二病
  • うりさん( @uri )の記事で，RからDockerを操作する方法や各種リンクなど情報がたくさん

rocker/tidyverse イメージ

RのDockerイメージとして最も有名なのがRocker Projectです。リンク先を見てもらえればわかるように，様々なイメージが公開され，日々更新されています。

その中でも，rocker/tidyverseというイメージに注目してください。これはtidyverseな環境を一気に持ってきてくれるイメージで，今回のコンセプトにバッチリです。なお，このイメージに関する説明はDockerHubにあるこちらの説明を参照してください。

さて，「じゃあもうrocker/tidyverseイメージを利用してコンテナ作れば解決じゃね?」と言いたいところですがそうはいきません。このイメージはあくまでグローバルなもので，日本(日本語)向けではありません。タイムゾーンや日本語化，そして日本語フォントなどの設定をしなければいけません。これは「たいぎぃ」ですね。

tokyor/rstudioイメージがある

2017/12/25 13:49追記: Dockerイメージの管理をtokyorから切り離し，別途rocker-jpというのを立てることにしました。次節へ飛ばしてください。

これらを現在クリアしているのがtokyor/rstudioイメージです。実はこのイメージは先日まで古いバージョンのままでしたが，先日私もSource Repogitory側の方へcontributorとして入りましたので，いくつか修正を行いました。

1. FROMをrocker/hadleyverseからrocker/tidyverseへ変更
2. 日本語用フォントとしてIPA系フォントを導入¹
3. rocker/tidyverseをリンクさせることで，リンク先のリポジトリがupdateされた時に自動的にリビルドするように

1により，Rの最新版，RStudio Serverの最新安定版へ移行し，tidyverseなパッケージ群も新しい物が導入されるようになります。また，また日本語も新たに追加しましたので，すんなりとggplot2などで日本語をplotしたりできます。さらに3にあるように，更新も自動的になりました。

つまり，tokyor/rstudioイメージでコンテナ作ればOK…なのですが，メンバーで協議した結果，新たに組織を作って運用していくことにしました。

そしてこれからはrockerjp/tidyverseへ

前節のとおりなのですが，tokyorでDockerまわりを続けるのもなぁということで切り離すことになりました。その名もrocker-jpです:

• https://github.com/rocker-jp (GitHubサイト)
• https://hub.docker.com/u/rockerjp/ (DockerHubサイト)

現在tokyor/rstudioで準備していたDockerイメージをそのままrockerjp/tidyverseとして移行し，またrocker/verseを日本語化したものをrockerjp/verseとして準備しています。

今後はこちらで運用していくこととなりますので，よかったら今後もチェックしてもらえればと思います。

今後のお話

せっかくcontributorに入れてもらえたので，もう少しいろんなイメージを準備できたらなと思ってます。今のところディスカッションしているのはrockerの中のイメージをベースに日本語環境を整えたものを提供する，などです。いつになるかはわかりませんが，ぼちぼちとやっていきたいと思ってます。

「まだ自分にはDockerなんてよくわからないし難しそう…」と思わずに，ぜひ一度試してみてください。そして「たいぎぃ」から開放されましょう。

Enjoy!

1. 2017/12/21 22:30時点では，IPAMinchoとIPAGothicが入っていますが，近々IPAexMinchoとIPAexGothicに切り替える予定です。 ↩