結論：logback(-test).xml の <pattern> 末尾に at %white(%C.%M\(%F:%L\) と入れる。

at IntelliJ にこの文章が stack trace の一部だと認識させ、FQCN 部分を認識して貰う。
%C: Fully qualified class name
%M: Method name
%F:%L: FileName : 行番号
%white : 付加情報を良い感じに一段穏やかにする（white と書いてあるが darkmode / lightmode 両方で良い感じに

最小構成で以下。

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<configuration>
    <appender name="CONSOLE" class="ch.qos.logback.core.ConsoleAppender">
        <encoder class="ch.qos.logback.classic.encoder.PatternLayoutEncoder">
            <!-- @formatter:off -->
            <pattern><![CDATA[%d{HH:mm:ss.SSS} [%thread] %highlight(%-5level){TRACE=blue,DEBUG=blue,INFO=green,WARN=yellow,ERROR=red} %cyan(%logger{36}) - %msg at %white(%C.%M\(%F:%L\)) %n]]></pattern>
            <!-- @formatter:on -->
            <charset>UTF-8</charset>
        </encoder>
    </appender>

    <!-- ルートロガー設定 -->
    <root level="DEBUG">
        <appender-ref ref="CONSOLE"/>
    </root>
</configuration>

ちなみに %C 部分が無くても () でファイル名と行番号を囲えば Clickable になることもあるが、その場合同名ファイルがあった場合ユーザー選択が必要になってしまう。

直前に FQCN を書いておけばよしなに扱ってくれる。