python初心者が、地球科学系の研究者に必要な環境の構築を目指しています。
アンインストール & 再インストール
こちらの記事にしたがって、再インストール。
https://qiita.com/opankopan/items/5171116b1727c3907e86
今回インストールしたのは、python3.7です。
(python-cdoがまだpython3.8に対応していないから。)
https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2020.02-Linux-x86_64.sh
PATHの設定をし直す。
~/.bashrc
export PATH=/home/[myname]/local/anaconda3/bin:${PATH}
仮想環境の構築
conda create -n [name] python=3.7.4
環境の切り替えは、
conda activate [name] # 起動
conda deactivate # 終了
名前をかえたくなったら、
https://qiita.com/TyaoiB/items/b858430c289767cb04be
導入したパッケージ
condaで導入したパッケージ
conda install -c conda-forgeでインストールすると、適したバージョンを探してくれる。オプション-y をつけると、一気にインストールしてくれる。
- python-cdo
- netcdf4
- xarray
- numpy
- pandas
- seaborn
- cartopy -> cdoをダウングレードすることに。先に入れておかないとあとで他のパッケージとconflict起こす。
- cmocean
- branca
- folium
- squarify
- wordcloud
- ipython
- jupyter
- jupyterlab
- plotly
- statsmodels
- scipy
- pillow
- click
- conda
- paramiko
pipで導入したパッケージ
- datetime
- geoplotlib
- janome
- gtool3
- pip install matplotlib==3.2.2 ->新しいversionだとbasemapが動かないので注意！(参考:http://ebcrpa.jamstec.go.jp/~yyousuke/matplotlib/info.html)
- netCDF4 -> errorが出たから入れたけど、condaでinstallしたのと何が違うの？？