公開したデータセット
内容
- 単細胞緑藻クラミドモナス単鞭毛変異株の鞭毛運動を200 fpsで撮ったaviファイル
- 暗視野顕微鏡を使用
- 約1分間の動画が生細胞46個体、除膜モデル(ゾンビ)56個体分
- DeepLabCutでのトラッキング結果のcsvファイル(鞭毛先端・基部・細胞体後端)
何に使えそうか?
- 鞭毛繊毛運動・細長い物体の動きの解析手法の評価
DeepLabCutでのトラッキング例
紫:鞭毛先端、緑:鞭毛基部、赤:細胞体後端公開したデータセットを使った論文
- Azusa Kage, Ken H. Nagai, Takayuki Nishizaka, Kenta Ishimoto. 2025. Revealing Rotational Characteristics of the Uniflagellate Mutant of Chlamydomonas reinhardtii through DeepLabCut-Based Autotracking. microPublication Biology. 10.17912/micropub.biology.001535.
- 実験条件などは上記を参照してください