はじめに
Homebrewについてです．
OSをアップデートした訳でもなく，何かをいじった記憶もなく，ある日から数時間〜1日時間をあけてbrew doctorをすると毎回「書き込み権限が無い」との警告が出るようになりました．
- brew doctor: Homebrewに問題がないか調べるコマンド
実際におきたこと
brew doctor で出る警告をまとめると，以下のようになります．
（実際には解決法も一緒に書かれています）
Warning: /usr/local/bin isn't writable.
Warning: /usr/local/share isn't writable.
Warning: Some directories in /usr/local/share/man aren't writable.
This can happen if you "sudo make install" software that isn't managed
by Homebrew. If a brew tries to add locale information to one of these
directories, then the install will fail during the link step.
これを解決するには，
sudo chown -R $(whoami):admin /usr/local
をして/usr/local/の所有をユーザーに戻す必要があります．
なぜか次にbrew doctorをするときには所有がrootに戻ってしまうのです．
毎回同じ警告が出て，毎回同じように解決していました．
原因を調べてみた
アンチ・ウイルスソフトの Sophos が原因らしいです！
homebrew に関して問題があるのかと探っていたので，予想外でした．
Macで/usr/local/binの所有者が勝手に変わる問題について
という記事に書かれていました．
Homebrew自体の問題なのかと思っていたのですが，実際はSophosの更新の度に起きる問題だったようです．ウイルス定義のアップデートなどもあり，わりと頻度は高かった気がします．
sudo fs_usage | grep "usr/local"
で，ファイルシステムへのアクセスを確認し，実際に何が原因なのかを確認できます．ただし，相当時間がかかります．
実際に確認してみた
sudo fs_usage | grep "usr/local"
をしたところ，Sophos Update という文字列を見かけました．
やはり原因はSophosだと思ったので，Sophosをアンインストールしました．
アンインストール後，brew doctorをしてもエラーが出なくなりました．
アンインストールする際の注意点なのですが，Sophosはゴミ箱に入れてもアンイストールされません．Remove Sophos Anti-Virusというアプリを，ダブルクリックして実行し，指示にしたがってアンインストールできます．
以下のフォーラムで，Sophosの担当者が，この問題に関して2015年11月上旬までには対処すると書いているのですが，まだ対処されていないようです．（2015/11/15現在）
'sweep' command installs itself into /usr/local and changes permissions, wreaking havoc on Homebrew - Sophos Anti-Virus for Mac Home Edition - Free antivirus & tools for desktops - Sophos Community
補足
ClamXAVでも同様の現象があるようです．こちらはインストール時のみのようです．
参考URL
- Macで/usr/local/binの所有者が勝手に変わる問題について
http://rcmdnk.github.io/blog/2015/10/13/computer-mac/ - Mac用アンチウィルスソフトとHomebrewの所有権についてまとめ
http://qiita.com/tozaiuser/items/8426ee90844b46f7e4ce - Sophos Anti-Virus for Mac のアンインストール方法
https://www.sophos.com/ja-jp/support/knowledgebase/120838.aspx