なぜか最新の環境（SDK 3.5.0.RC、CLI 3.5.0-dev）でビルドしても、プロダクト（アドホック）ビルド以外は 32bit でインストールされてしまうため、シミュレータやデバッグ時のデバイスビルドは 64bit でテストを行うことができません。毎回アドホックビルドは面倒です。。。
試しに $ ti build -p ios --sim-64bit 等でビルドしてみてください（そもそも --sim-64bit オプションは Xcode6 からのシミュレータでは意味がないかも）。build/iphone/build/XXXXX.build/Debug-iphoneos/XXXXX-iPad.build の中身を見てみると、i386 や armv6、もしくは armv7 しか存在しないのがわかります。実機ビルドをして、Instruments でアクティビティを確認してみましょう。アーキテクチャが arm64 で動いていません。
原因はビルド時のテンプレートにある ONLY_ACTIVE_ARCH が YES になっているためです。このテンプレートは SDK に内包されており、RC 環境でテストしているのであれば手動で書き換えてしまっても、GA が正式リリースされれば問題ないかと思います。
それでは手動で ONLY_ACTIVE_ARCH を NO にしてみましょう。SDK 3.5.0.RC がインストールされているディレクトリまで移動しましょう。デフォルトでは以下の場所にビルド時のテンプレートが存在します。
~/Library/Application Support/Titanium/mobilesdk/osx/3.5.0.RC/iphone/iphone/Titanium.xcodeproj/project.pbxproj
このファイルをテキストエディタで開き、ONLY_ACTIVE_ARCH を探してください。ONLY_ACTIVE_ARCH = YES; になっているので、これを ONLY_ACTIVE_ARCH = NO; に変更して保存します。
保存後に再度ビルドしてみましょう。先ほどのビルドフォルダに i386 や armv6、もしくは armv7 の他に x86_64 と arm64 が生成されていますか？生成されていれば成功です。更に Instruments で確認してみましょう。アーキテクチャが arm64 で動いていますか？これで 64bit のテストできますね！