二次元配列をDecodeしたかっただけやねん(´・ω:;.:...

一旦List<dynamic>にしてからList<List<int>>にすればできました。

List<dynamic>.from(jsonDecode("json文字列"))
    .map((line) => List<int>.from(line))
    .toList();

お試し

    // 二次元配列をJSONに
    var array2d = [
      [1, 2, 3],
      [4, 5, 6],
      [7, 8, 9]
    ];
    var jsonStr = jsonEncode(array2d);

    // 二次元配列に変換
    List<List<int>> decodedArray2d = List<dynamic>.from(jsonDecode(jsonStr))
        .map((line) => List<int>.from(line))
        .toList();

    print(decodedArray2d);