JavaでList同士の比較をする

java

hogeList.equals(fugaList);

で、可能です。
List#equals は順序保証含めて等値性判定する（厳密）ので、
Listにする前にSQLでOrber Byとかしておいたほうが良いです。

重複要素を省いてもいいのであればHashSet に変換後にequals する手段もあります。