Atomでrubocopを使おうとした際にエラーが発生したので解決法とともに共有します。

したこと

gem install rubocop
Atomのパッケージの Linter と linter-rubocopをインストール

エラー内容

ここでエラーが発生しました。

Atomでのエラー内容

[Linter] Error running RuboCop Error: Failed to spawn command `/Users/home/shims/rubocop`. Make sure `/Users/home/shims/rubocop` is installed and on your PATH
    at /Users/home/.atom/packages/linter-rubocop/node_modules/atom-linter/lib/helpers.js:130:24
    at <anonymous>
    at process._tickCallback (internal/process/next_tick.js:188:7)

rubocop 自体に問題があるのか確認するためにコマンドラインから rubocopを動作させると、

$ rubocop app.rb
rbenv: rubocop: command not found

The `rubocop' command exists in these Ruby versions:
  2.4.1

このようなエラーが発生したので上手く rubocop　が動いていなことを確認。

修正方法

.rbenv ディレクトリが私の場合はhomeディレクトリにあったので、そこの ~/.rbenv/bin/ に入っているrubocopを使用します。
~/.rbenv/versions/2.4.1/bin/rubocop app.rb で正しく動作しました。 (2.4.1の所は上記でエラーが出たversionに合わせる)

この方法で動作することが確認できたら、Atom側のrubocopも修正を行います。設定 → Package から linter-rubocop を検索します。検索するとSettingsのCommandという所があるのでそこを書き換えます。Defaultだと rubocop になっているはずです。
そこに上記の ~/.rbenv/versions/2.4.1/bin/rubocop を書いてあげれば無事動作しました。