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tar/gzで圧縮しながらS3に転送する

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tar cf - ディレクトリ名 | gzip --best | aws s3 cp - s3://バケット/ファイル名.tar.gz

でローカルにtar.gzファイルを置かずにS3に転送できます

参考になったページ

https://dev.classmethod.jp/cloud/aws/aws-cli-s3-streaming/