UIImagePickerControllerのallowsEditingで正方形クロップするときに、クロップ位置がズレて表示されてしまい困っていたら、こちらに答えがありました。
UIViewControllerBasedStatusBarAppearance を確認しよう
info.plistなどで UIViewControllerBasedStatusBarAppearance を設定しているとこの不具合が発生するようです。
この項目を削除したら解決しました。
当然ステータスバー周りの挙動も変化するので、そこは別途修正しましょう。