Vagrantを開発環境として使っていてテストなどで時間を過去に設定したい時、以下のコマンドを実行することでホストとの時刻同期を止めることができます。
$ date
Tue Jul 11 01:39:04 UTC 2017
$ sudo service vboxadd-service stop
その後はdateコマンドで任意の時刻を設定します。
$ sudo date -s "2017/07/02 01:40:00"
$ date
Sun Jul 2 01:40:02 UTC 2017
テストが終わったら同期するよう戻します。
$ sudo service vboxadd-service start
$ date
Tue Jul 11 01:50:04 UTC 2017