症例
通常のSeleniumの使用法として，
from selenium import webdriver
driver = webdriver.Chrome()
driver.get('http://google.co.jp')
などと実行する分には動作します．しかし，そのあと
driver.save_screenshot('image_path.png')
driver.get('http://yahoo.co.jp')
などと処理を続けたり特定の処理を行うと
selenium.common.exceptions.WebDriverException: Message: An unknown server-side error occurred while processing the command.
や
selenium.common.exceptions.WebDriverException: Message: A session with id = 'hogehogehoge' was not found.
などと例外を発生して動作が停止してしまうことがあります．
どの処理が悪いのかは完全には分かっていませんが，save_screenshot()はエラーを起こす黒い操作であると思っています．
結論
Mac OSのバージョンにあったSafari Technology Previewを入れ直しましょう．
Safari Technology Previewとは
Safari Technology Previewは，今後Mac OSやiOSのSafariに組み込まれるかもしれないWebテクノロジーを試してみるためのブラウザです．
筆者は，Webページ全体のスクリーンショットを撮るために使っています．
環境
| 名前 | バージョン |
|---|---|
| Selenium with Python | 3.12.0 |
| Safari Technology Preview | 11.2 |
| Mac OS | High Sierra 10.13.4 |
| Python | 3.6.4 |
よくある発症ケース
1. Mac OSをアップデートした時
Mac OSをSierraからHigh Sierraにアップデートする場合（もしくは他のバージョンからHigh Sierraなどにアップデートする場合），最初の数回の動作はOSのバージョン違いのようなエラーを吐くことなく機能します．
ただ，少し操作を続けたりある特定の動作を行うと上記の症例のようにAn unknown server-side errorという情報量≒0なエラーを起こします．
2. テキトーなバージョンのSafari Technology Previewをインストールした場合
実行中は，1.の場合と同じように，OSのバージョンが違うといった警告を出すことなく動作しますが，いきなり動作を停止します．
（インストール時にエラーを出してくれるかどうかは未確認です．）
解決策
いまインストールしてあるSafari Technology Previewをアンインストールして，正しいバージョンのSafari Technology Previewをインストールし直します．
1. いまあるSafari Technology Previewのアンインストール
「Finder」→「アプリケーション」→「Safari Technology Preview」を選択し，「（右クリック）」→「ゴミ箱に入れる」（→「ゴミ箱を空にする」）と操作を行うと簡単にアンインストールできます．
2. 正しいバージョンのSafari Technology Previewのインストール
Safari Technology Previewのダウンロードページから，正しいバージョンのインストーラをダウンロードしてきて，ダブルクリック&実行をします．
おまけ
OSのバージョン違い以外にもAn unknown server-side errorが出た場合は，Webdriverが壊れたというような原因もありえるのでSafari Technology Previewの再インストールは有効な場合もあると考えられます．