普段Titaniumでコードを書くときにプロジェクトの作成からbuild等をする際にTitanium Studio（今はAppcelerater Studioですね）を使っていないので、ターミナルからiTunes Connectに登録する方法を紹介します。
やり方はとても簡単！
iPhone/iPadの場合
$ti build -p ios -T dist-appstore
Androidの場合
$ti build -p android -T dist-playstore
iPhone/iPadの場合のコマンド入力後は、Xcodeを起動し、Window/organizerに移動し、Upload to App Storeをクリック。（このコマンドを入力する前には、プロビジョニングプロファイルのdistributionを作成しなければなりません。）
Androidの場合はのコマンド入力後は、プロジェクトファイル/dist/~.apkが作成され、playストアにアップロードで申請できます。