まずは、アナコンダにRDKitをインストールして
ケモインフォマティクスを始めましょう。
１、アナコンダを起動して、
仮想環境を作り、
ターミナルを開く。
２、rdkitをインストール
conda install -c rdkit rdkit
３、必要なライブラリも入れましょう。
Jupyter、scikit-learn など
簡単ですね。
次は、Google Colaboratory にRDKitをインストールして
ケモインフォマティクスを始めましょう。
こちらも、アナコンダの場合と
基本的には同じですが、注意点が２点あります。
１、condaがインストールされていない。
２、pythonの環境が２つ存在している。
conda 環境：追加インストールされる場所。
Colaboratory 環境：pathを通して利用する。
３、まずはインストールです。
%%bash
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
chmod +x Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b -f -p /usr/local
conda install -c rdkit rdkit
４、pathを通します。
import sys
sys.path.append('/usr/local/lib/python3.7/site-packages/')
５、必要なライブラリーは 全部入ってます。
簡単ですね。
さあ、ケモインフォマティクスを始めましょう。
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