同じ値を持つ配列を比較しても等価にならない

同じ値を持つ配列二つを比較しても、等しくない。

var array1 = new int[] { 4 };
var array2 = new int[] { 4 };

// Trueが出力される（二つの配列が持つ値は等価である）
Console.WriteLine(array1[0].Equals(array2[0]));

// Falseが出力される（二つの配列は等しくない）
Console.WriteLine(array1.Equals(array2));

配列ではなく、数値型の変数で比較したら、等価である。

var int1 = 4;
var int2 = 4;

// Trueが出力される（二つの数値は等価である）
Console.WriteLine(int1.Equals(int2));

つまりクラスのようにnewしたオブジェクトは、たとえ一時的に同じ値を持っているとしても、比較したら等しくない。

var class1 = new Hoge();
var class2 = new Hoge();

// Falseが出力される（二つのクラスは等しくない）
Console.WriteLine(class1.Equals(class2));

先ほど等しくないと認定された配列やクラスも、比較先の変数をまるっと代入すれば等価になる。

array1 = array2;

// Trueが出力される（二つの配列は等価である）
Console.WriteLine(array1.Equals(array2));

class1 = class2;

// Trueが出力される（二つのクラスは等価である）
Console.WriteLine(class1.Equals(class2));

これは、array1やclass1に代入されていた値はもう見なくなり、array2やclass2の中身（参照先）を見るようになるから。

なお、文字列は、同じ値を持っていたら同一である。
文字列は参照型。したがって、「参照型は同じ値でも等しくない」とは言えず、今回の話題とはまた別の話。

var string1 = "hoge";
var string2 = "hoge";

// Trueが出力される（二つの文字列は等価である）
Console.WriteLine(string1.Equals(string2));

（以下コメントいただいた内容について、追記しました。）

Linqでシーケンスを扱うためのSequenceEqualメソッドを使用すると、配列の要素が全部同じかどうかを判定してくれる。

using System.Linq;

var array1 = new int[] { 4 };
var array2 = new int[] { 4 };

// Trueが出力される（二つの配列が持つ値は等価である）
Console.WriteLine(array1.SequenceEqual(array2));