githubからwebhookで自動pullが失敗する

現状

wordpressのプラグインで自動更新するもの（wordfence)を
git管理下に含めていた。
またwebhookを利用していて本番でもgit管理をしている状態で
gitpullをしている中でadd前の編集されたファイルができるので
コンフリクトを起こし自動プルが失敗している状態。

add前の編集をなかったことに

removeadd.sh

$ git checkout .

特定のディレクトリ以下の編集を無かったことにするなら以下

removeadddir.sh

$ git checkout languages/.

特定のファイルの編集を無かったことにするなら以下

removeadddir.sh

$ git checkout example.php

このコマンドでdeletedされたファイルやmodifiedされたファイルが元に戻せます。

Untracked filesが残る

git checkout .ではUntracked filesが残っていると思います。
Untracked filesが残っている場合は
git cleanもしくはgit rmで一つづつ削除する必要があります。
git cleanを実行する場合は注意が必要です。
必ずパスを指定して削除範囲を最小限に絞りつつ
以下のコマンドで事前確認をしましょう。

cleann.sh

$ git clean -n <PATH>

削除されるファイルが確認できたら
以下のコマンドで実行します。
この時、PATH以下のディレクトリに.gitignoreで
指定しているディレクトリ＆ファイルがないようにしましょう。
.gitignoreで管理外にしているディレクトリ、ファイルも
git cleanコマンドは削除してしまいます。

cleanf.sh

$ git clean -f <PATH>