関数

関数は、関数です。
「function」の名の通り、「機能」です。
これはまあ理解できますね。

// 二つの整数を足す関数（機能）
func plusWithNum(num1: Int, num2: Int) -> Int{
    return num1 + num2
}

// 実行
plusWithNum(3, num2: 5)

メソッド

問題はメソッドについてです。
メソッド（method）という単語を辞書で引いてみると〜「方法」や「手段」と訳されています。
つまり、メソッドは、関数と同じように戻り値を返すこともできますが、基本的にはインスタンスのプロパティを操作する方法（メソッド）として使うものだと推測されます。

// Scoreクラス
class Score {
    var score: Int = 0 // クラスの変数（プロパティ）
    
    // scoreを設定するメソッド
    func setScoreWithPoint(point: Int){
        score = point
    }

    // scoreを追加するメソッド
    func addScoreWithPoint(point: Int){
        score += point
    }
    
    // 値を返すメソッド
    func plusWithNum(num: Int) -> Int{
        return score + num
    }
}

メソッドを実行するためには、インスタンスを作成して実行する。

let score = Score()
score.setScoreWithPoint(3)
score.addScoreWithPoint(6)
var num = score.plusWithNum(4)

メソッドは、インスタンスに関して実行するので、<インスタンス>.<メソッド> と書きます。
値を返すplusWithNum(_:)はどうでしょうか。クラスのプロパティを使っていますが、プロパティを変更はしていないので、メソッドとしては意図された使い方ではないと思われます。
こういう時は、var num = score.point + 4 とすればよいですね。

結論

メソッドは、インスタンスのプロパティを操作するための関数。

P.S. 変なところなどありましたらコメントください。