環境はosx yosemite 10.10.5
ruby -v 2.1.3

自分の場合は
rake db:createをしようとした時に、

Could not find rake-11.2.2 in any of the sources
Run `bundle install` to install missing gems.

このようなエラーが吐かれ、rakeコマンドが使えなくなった。
当然、rake routesもrake db:migrateもできない。

#rubyの確認

MacBook-Pro-3:app user_name$  which ruby
/Users/user_name/.rbenv/shims/ruby

#bundleの確認

ここで、本来ならば、bundleもrakeも.rbenv配下を見て欲しいのだが、

MacBook-Pro-3:app user_name$ which bundle
/usr/bin/bundle
MacBook-Pro-3:app user_name$ bundle show rake
/Library/Ruby/Gems/2.0.0/gems/rake-11.2.2

両方とも.rbenv配下を見に行ってない。

#修正作業　　bundleのインストール

MacBook-Pro-3:app user_name$ rbenv exec gem install bundler
Successfully installed bundler-1.12.5
Parsing documentation for bundler-1.12.5
Done installing documentation for bundler after 2 seconds
1 gem installed

MacBook-Pro-3:app user_name$ rbenv rehash

MacBook-Pro-3:app user_name$ which bundle
/Users/user_name/.rbenv/shims/bundle

bundleは.rbenv配下に入った。

しかし、
rakeあるはずだけどrakeがない見つからないと言われる・・・。

MacBook-Pro-3:app user_name$ bundle show rake
Could not find rake-11.2.2 in any of the sources

#rakeのinstall

MacBook-Pro-3:app user_name$ gem install rake
Fetching: rake-11.2.2.gem (100%)
rake's executable "rake" conflicts with /Users/user_name/.rbenv/versions/2.1.3/bin/rake
Overwrite the executable? [yN]  y
Successfully installed rake-11.2.2
Parsing documentation for rake-11.2.2
Installing ri documentation for rake-11.2.2
Done installing documentation for rake after 0 seconds
1 gem installed

rakeのインストールできた！！！！

#bundle install実行

MacBook-Pro-3:app user_name$ bundle install
Fetching gem metadata from https://rubygems.org/
Fetching version metadata from https://rubygems.org/
Fetching dependency metadata from https://rubygems.org/
Using rake 11.2.2
Installing i18n 0.7.0
Installing json 1.8.3 with native extensions
...
...
...
.
.
.
.
.
Bundle complete! 14 Gemfile dependencies, 69 gems now installed.
Use `bundle show [gemname]` to see where a bundled gem is installed.

これで晴れてrakeコマンドが使えるようになる。