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理系大学生は研究でもJupyterNotebook(Anaconda)ではなくVScodeを使おう+Python環境構築

Last updated at Posted at 2023-05-24

はじめに

理系大学生諸君は、実験で得たデータの解析やグラフ作成にPythonを使っているでしょうか? 私の所属する研究室では、PythonまたはNgraphでグラフを作ることが推奨されています。
特定のグラフ作成ソフトと比べてPythonでグラフを作るメリットというのはいくつかありますが、各設定項目をテキストデータとして確認ができる(明確に記述されている)ところが一番のメリットだと思います。そんなPythonですが、Anacondaをインストールして、その流れでJupyter Notebookを使って解析する人が多いと思いますが、VScodeを使って解析したほうが良いと考える理由と、実例を上げていこうと思います。

Jupyter Notebook(Anaconda)は開発環境とそのエディタであり、VScodeはエディターであるため、直接的な比較は本来できないのですが、やんわりと流してください。

VScodeを使うメリット

  1. 設定のカスタマイズが豊富
    外観の設定や、キーボードショートカットなどが豊富であり、よりパーソナライズされた開発体験を得られます。
  2. 情報が多い
    VScodeは現在世界で一番普及しているコードエディターであり、日本語の記事もあふれるほどあります。知りたいことがあればほとんどすべてのものはすでに解決されていると思います。
  3. 自由な実行環境を選択できる
    VScodeは良くも悪くもエディターであるので、ベースとなる環境は自分で選択できます
  4. 豊富な拡張機能
    一番のメリットです。これまで作られた数々の拡張機能は、開発体験を格段に向上させてくれます。
  5. gitが使いやすい(optional)
    gitの扱いに慣れる必要はあるのですが、僕はwordファイルをgitでバージョン管理しています。txtファイルに変換するコードを組んでおけば、gitのdiffで変更点も見れるので後から確認するのに非常に有用。

環境構築

個人的なベストプラクティスはDockerを使い、仮想環境で開発をすることです。よくわからない方も、とりあえずインストラクションに従ってみてください。
環境構築はWindowsでおこないます。

VScodeインストール

公式サイトにアクセスしてVScodeをインストールしましょう。
image.png

WSLインストール

Microsoft StoreでWSLと検索して以下のアプリケーションをインストールしましょう。
image.png
(絶妙にペンギンのアイコンがキモい)
Storeリンク

Docker Desktop インストール

公式サイトにアクセスしてDocker Desktopのインストーラをダウンロードし、実行しましょう。
image.png

終わったら一応再起動しておきましょう。

セットアップ

Docker Desktopを起動しておきます。起動しておかないと後でエラーが起きるので、毎回起動するのが面倒という人はDocker Desktopの設定からStart Docker Desktop when you log inにチェックを入れておくといいと思います。
image.png

VScodeを起動し、ファイル>フォルダーを開くから自分の研究用のデータが入っているフォルダを開きます。
image.png

四角が集まったようなアイコンを押して、Devcontainer拡張機能をインストールしておきましょう。
image.png

Ctrl+Shitt+Pを押し、reopenと入力するとおそらく出てくる、Dev Container: Reopen in Container(開発コンテナー: コンテナーで再度開く)をクリックします。そして画像のようにすべての定義を表示を選択します。

image.png

pythonと入力し、出てきたPython3を選択します。

image.png

後はエンターを数回押すだけです。そしてコンテナの立ち上げにそこそこ時間がかかるので気長に待ちましょう。

うまくいっていれば、左下に開発コンテナー:Python3と表示されているはずです。
image.png

jupyter拡張機能をインストールしましょう。
image.png

Ctrl+Shift+Pからreload windowで画面を再読込して、拡張機能の有効化を完了しておきましょう。

試しにmain.ipynbを作成して、HelloWorldしてみましょう。ファイルの作成は左上の方からできます。
image.png

セルを選択して、Ctrl+Enterで実行できます。画像に従って進めていきましょう
image.png

image.png

image.png

これで実行できたはずです。更に詳しい設定についてはこちらの記事で紹介しています。

余談

この記事は自分の研究室の同期に紹介するテンションでできるだけ簡潔に環境を整えられないかと考えて書いた記事です。本当はもっと深いカスタマイズまで紹介したいのですが、あまり長ったらしくなると投げ出してしまうかな...と思いながら推敲しました。

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