動作環境

Xeon E5-2620 v4 (8コア) x 2
32GB RAM
CentOS 6.8 (64bit)
openmpi-1.8.x86_64 とその-devel
mpich.x86_64 3.1-5.el6とその-devel
gcc version 4.4.7 (とgfortran)
NCAR Command Language Version 6.3.0
WRF v3.7.1を使用。

関連 bash > 可変列の3ファイルを合成して、各行に3項目ずつ出力する実装 > 遅い実装と速い実装
のPython実装。

参考 http://stackoverflow.com/questions/7637957/reading-space-separated-input-in-python

combine_3files_170315.py

# !/usr/bin/env python

with open('out_val_170315') as vfp:
	val = vfp.read()
with open('out_lat_170315') as afp:
	lat = afp.read()
with open('out_lon_170315') as ofp:
	lon = ofp.read()

for elm in zip(val.split(),lat.split(),lon.split()):
	print(elm)

bashで処理しても、その後の処理(緯度経度値によるフィルタなど)はPythonの方が楽な気がしてきたのでPythonに変更した。

結果

$ python combine_3files_170315.py | head
('0.00', '36.07', '131.17')
('0.00', '36.07', '131.29')
('0.00', '36.07', '131.41')
('0.00', '36.07', '131.53')
('0.00', '36.07', '131.65')
('0.00', '36.07', '131.77')
('0.00', '36.07', '131.89')
('0.00', '36.07', '132.01')
('0.00', '36.07', '132.13')
('0.00', '36.07', '132.25')