.gitignore を設置

GitHub に .gitignore のテンプレートがあるのでそれを使うとらくです。

.gitignore をコミット

チームで開発していたり、複数のマシンで編集する可能性がある場合は、他の環境でも同様にこれらのファイルを無視してくれるように、.gitignore 自体をコミットしてしまいましょう。

$ git add .gitignore
$ git commit -m "Add ignore pattern"

.gitignore を設置しても、既にリポジトリに登録されているファイルは無視されないので、無視したいファイルを管理対象から外します。

$ git rm --cached hoge.tmp

（なお、管理対象から外れるだけで、ローカルにあるファイルは削除されません）

ただ、既に大量のファイルが登録されている場合、これをひとつひとつやっていたら大変なので、以下のように git ls-files の -i と --exclude-from オプションを使って、まとめて除外するとらくです。

$ git rm --cached `git ls-files --full-name -i --exclude-from=.gitignore`

-i は --ignored の略で、Git に登録されているファイルの内、次に指定する方法で無視するファイルの一覧を出力します。
--exclude-from=<ignore-file> を指定すると、<ignore-file> に記述されたパターンにマッチするファイルを、無視するファイルとして扱います。
--exclude-standard を指定すると、Git が標準で無視リストとして扱う .gitignore や .git/info/exclude などのファイルに書かれたパターンにマッチするファイルを、無視するファイルとして扱います。

--exclude-standard を使う場合は、以下のように入力します。

$ git rm --cached `git ls-files --full-name -i --exclude-standard`

最後に、確認して問題なければコミットしましょう。

$ git status
$ git commit -m "Remove ignore files"