<?php
$scores = [];

do{
    echo '点数を入力 >';
    $score = (int)trim(fgets(STDIN));
    if ($score === -1){
        break;
    }

    $scores[] = $score;
    $sum = 0;
    for ($i = 0; $i < count($scores); $i++) {
        echo $i + 1 . ':' . $scores[$i] . PHP_EOL;

        $sum += $scores[$i];
    }
    echo '合計：' . $sum . PHP_EOL;

} while(true);

/*
80=>
点数を入力 >80
1:80
合計：80

80=>
1:80
2:80
合計：160
点数を入力 >
*/

上コードは入力した値とその合計を出力する。

<?php
$scores = [];
$sum = 0;
do{
    echo '点数を入力 >';
    $score = (int)trim(fgets(STDIN));
    if ($score === -1){
        break;
    }

    $scores[] = $score;
    for ($i = 0; $i < count($scores); $i++) {
        echo $i + 1 . ':' . $scores[$i] . PHP_EOL;

        $sum += $scores[$i];
    }
    echo '合計：' . $sum . PHP_EOL;

} while(true);

/*
80=>
点数を入力 >80
1:80
合計：80

80=>
1:80
2:80
合計：２４０
点数を入力 >
*/

$sum = 0;の場所を変えるとうまく動作しなくなった。
=>
scoresには今まで入力した値が格納されており、合計(sum)はscoresの配列の値を足し合わせている。
つまり、sumは繰り返し処理の際に毎回０にしないと値が重複してしまう。
※①80を入力
scores =[80];
合計：80
②80を入力
scores =[80,80];
合計：80（前に残った値）＋80+80=240

へんに詰まってしまった...