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pandas クロス集計でユニーク値の総計を求める

Last updated at Posted at 2016-11-01

###目的
pandasで2つのカテゴリ変数でvalue変数をクロス集計し、value変数のユニーク値の総計を求めたい。

###SQLで書くと以下のコード

SELECT date,carrier,count(DISTINCT host) as cnt
FROM apachelog
GROUP BY date,carrier;

集計イメージ

date とcarrier変数(カテゴリはAndroid,iOS,Otherの3種類)ごとに、変数hostのユニーク値をカウント

date Android iOS Other
2015/04/01 5000 1300 15
2015/04/02 5200 1230 16
2015/04/03 5300 1100 17
... ... ... ...

python3でのコード(1) pivot_tableメソッドを使う

クロス集計(カラムB×カラムC)の各セルごとのカラムAの平均値

 pd.pivot_table(df,value='A',index='B',columns='C')

クロス集計(カラムB×カラムC)の各セルごとのカラムAの個数

 pd.pivot_table(df,value='A',index='B',columns='C',aggfunc = 'count')

クロス集計(カラムB×カラムC)の各セルごとのカラムAの総計

 pd.pivot_table(df,value='A',index='B',columns='C',aggfunc = 'sum')

では、各セルごとのカラムAのユニークな値の個数はどうするか?
lambda式を使います。
lambda式の書き方は、lambda 引数1,引数2 ・・・ :処理

pivot_unique.py
import pandas as pd

#データはpandasのデータフレームにしておく
df = pd.DataFrame(apachlog)

#以下のやり方ではna値を含んだ値になります。
#あらかじめデータフレーム.info()でnaがないと分かっている時には使える手
pv = pd.pivot_table(df, values='host',index = 'date',columns = 'carrier',
 aggfunc = lambda x:len(x.unique()))

#以下のやり方は、na値を除いた値になります。
pv = pd.pivot_table(df, values='host',index = 'date',columns = 'carrier',
 aggfunc = lambda x:x.nunique())

(おまけ)ファイルにエクスポート

pandasのデータフレームはto_csvメソッドでtsv形式でエクスポートできます。

output.py
fout = 'output.tsv'
f = open(fout,'w',encoding = 'utf-8')

pv.to_csv(fout,sep = '\t')
f.close()

python3でのコード(2) groupbyメソッドを使う

use_groupby.py
#x軸、y軸を指定してグループバイオブジェクトを作る
grouped = df.groupby(['date','carrier'])

#データフレームにgroupbyしても結果が出てくるのではなく、集約キーが付与されたデータフレームのGroupByオブジェクトが生成されるだけ

#groupedオブジェクトに対して、カラム「host」で集約する。
#集約する関数は、agg(この中身をラムダ式で指定)
#naもユニーク値に含まれるカウント
grouped.host.agg(lambda x: len(x.unique()))

#naを含まないカウント
grouped.host.agg(lambda x: x.nunique())

groupbyメソッドの集計結果は、「縦持ち」(=long型)テーブルになります。

date carrier
2015/04/01 Android 5000
2015/04/01 iOS 1300
2015/04/01 Other 15
2015/04/02 Android 5200
... ... ...

「縦持ち」(long型)をクロス型(?というのでしょうか?)(=wide型)に展開したい場合、以下のようにunstackメソッドを使えば、上の集計イメージを得られます。

#g = grouped.host.agg(lambda x: len(x.unique()))
g = grouped.host.agg(lambda x: x.nunique()))

g.unstack()

実行環境

  • anaconda3-4.0.0
  • OS X El Capitan 10.11.3

###参考

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