プロジェクトのコードの他に PyPI のモジュールにもタグジャンプできるとコードの深追いが出来てハッピーです。
色々なやり方があると思いますが、自分はプロジェクトのルートディレクトリでワンライナーを叩いてます。
$ctags -R `pyenv prefix`/lib/python2.7 `pyenv prefix`/lib/python2.7/site-packages .
環境は pyenv で python 2.7 系の利用を前提としています。
あとはお気に入りのエディタでタグジャンプの設定をして快適な ctags ライフを送りましょう！